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TP – DIGESTION DES GLUCIDES
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1. TP ETUDE DES ENZYMES Le but de ce TP est d tudier un type de prot ine particulier les enzymes Nous prendrons l exemple de l amylase enzyme pr sente dans la salive e L eau iod e lugol permet de tester la pr sence de polym re de glucose tel que l amidon CsH0O5 Il suffit de placer quelques gouttes sur la substance tester e La liqueur de Fehling bleue permet de tester la pr sence de sucres r ducteurs comme le glucose CH 05 Il suffit de placer l 2 ml de la solution tester dans un tube essai d y rajouter l 2 ml de liqueur de Fehling et de porter bullition Il faut s arr ter avant les premi res bulles Attention Les tubes doivent TOUJOURS tre tourn s vers un mur et JAMAIS vers quelqu un A Mise en vidence des glucides de la mie de pain 1 Mettez quelques gouttes d eau iod e lugol sur de la mie de pain Comparez un t moin n gatif eau D crivez la r action et concluez 2 R alisez la r action la liqueur de Fehling chaud sur de la mie de pain m lang e de l eau compar e un t moin Sch matisez le r sultat et concluez B Action de la salive sur la mie de pain Si on laisse une heure de la salive au contact de la mie et si l on r alise ensuite les tests l eau iod e et la liqueur de Fehling on obtient les r sultats suivants 1 La coloration de l eau iod e reste jaune et 2 11 y a un tr s abondant pr cipit rouge brique avec la
2. un atome une cha ne des mol cules Pour cela cliquez sur le bouton puis cliquez sur l atome que l on veut s lectionner et enfin de pas oublier de d cliquer le bouton de s lection e Le cadre inf rieur affiche des informations au fur et mesure des actions 7 Ouvrez le fichier amylase complex e avec fragment avec le logiciel RasTop Affichez en sph res et observez les oxyg nes isol es sont en fait des mol cules d eau car aucun atome d hydrog ne n est repr sent Affichez ensuite en ruban pour observer la structure de la prot ine D crivez la bri vement 8 Affichez les liaisons hydrog nes Dites o elles sont principalement localis es et d duisez en un r le possible 9 Choisissez la repr sentation en b tonnets sans les liaisons hydrog ne Dans le cadre Propri t s choisissez Prot iques et s lectionnez bouton avec un carr bleu sur un carr blanc S lectionnez la repr sentation en sph res seule la prot ine est affect e puis colorez par cha ne Vous pouvez alors observer la localisation du fragment d amidon repr sent en b tonnets rouge et gris D crivez sa position 10 Emettez alors une hypoth se sur le fonctionnement de cette prot ine 11 En reprenant l ensemble de votre travail r sumez comment et dans quelles conditions la salive agit sur l amidon de la mie de pain
3. liqueur de Fehling 3 Par comparaison avec les r sultats obtenus en A d finissez le r le de la salive dans la digestion de la mie de pain C Action de la salive ou de l amylase sur l empois d amidon L empois d amidon est obtenu en d layant de l amidon en poudre dans de l eau puis en portant l ensemble bullition On utilisera de l amylase purifi e prot ine pr sente dans la salive TUBES A REALISER NB Comme l on cherche comparer les tubes il est important que les quantit s soient identiques d un tube l autre on remplacera donc les l ments absents par de l eau distill e Cette tude n est pas quantitative la valeur pr cise des quantit s n a donc pas beaucoup d importance vous pouvez compter un centim tre de hauteur dans le tube au lieu de 1ml L amylase dont on veut tudier l effet sera ajout e au dernier moment dans les tubes concern s 3 5 ml 1 ml 5 gouttes Conditions Rs Saccharose a Ea Soude Temp rature pH Tube 1 37 C neutre Tube 2 X 37 C neutre Tube 3 X X 37 C neutre Tube 4 X X 37 C neutre Tube 5 X 37 C basique Tube 6 X X 0 C neutre Tube 7 X X 37 C neutre Tableau de la composition des tubes r aliser 4 R alisez les 7 tubes et laissez les reposer pendant 10 minutes Puis e placez quelques gouttes de chaque tube sur la plaque de titration et r alisez le test l eau iod e e Pr levez une partie de chaq
4. ue tube et pratiquez le test la liqueur de Fehling Notez les r sultats dans un tableau n indiquez pas seulement ou mais ce que cela signifie 5 Interpr tez les r sultats en comparant chacun des tubes 3 7 un t moin 6 Ecrivez la r action de d gradation de l amidon en pr sence d amylase A Etude structurale de l amylase La structure de certaines enzymes est connue Par la technique de la cristallographie aux rayons X les scientifiques ont labor des mod les mol culaires de l enzyme seule ou de l enzyme avec son substrat On cherche comprendre les modalit s de l action de l enzyme sur le substrat en tudiant un mod le pr sentant l amylase et un petit fragment d amidon Mode d emploi succinct de RasTop Rotation de la mol cule souris bouton gauche enfonc D placement de la mol cule souris bouton droit Zoom souris touche majuscule Coloration possible en fonction de l atome des chaines Menu Atomes Colorer Les liaisons hydrog nes faibles et les ponts dissulfures liaisons covalentes entre deux Soufre peuvent tre affich s Menu Liaison choisir Type B tonnets et rayon entre 50 et 250 e Les boutons sur fond bleu change le mode de repr sentation des mol cules ou des parties s lectionn es sph res sph res et b tonnets b tonnets ruban polypeptidique e A leur droite et sur la ligne inf rieure boutons permettant de s lectionner une partie
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