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1. e come L Organizzazione delle Nazioni Unite ha istituito un piano d azione mondiale per preser vare la biodiversit delle risorse fitogenetiche per l alimentazio ne e l agricoltura La Svizzera come firmatario ha sviluppato un proprio piano d azione nazionale conformemente alle linee guida internazionali Le principali attivit legate a questo piano consistono nello stabilire un inventario delle risorse fitogenetiche selezionare le variet e adesioni secondo i criteri definiti conservare in modo appropriato e sostenibile queste variet descriverle morfologicamente identificarle e autentificarle Questi compiti sono stati suddivisi in diversi gruppi di esperti in funzione delle speci in questione Per certe speci l identificazione e l autentificazione utilizzano delle tecniche di profilatura molecolare e l accento posto sull allestimento di collabo razioni internazionali per validare le variet e i loro profili genetici national poursuivent leur important travail d inventaire de description de choix de conservation et d identification vari t ne doit pas tre pr serv e par un seul e En fonction des esp ces la probl matique varie beaucoup m me si les lignes directrices sont conservatoire mais qu une duplication des ressources phytog n tiques pour l alimentation et l agriculture RPGAA est n cessaire et permet d viter que certaines accessions disparaissent la suite d une contamina2. t cultiv e pendant plus de trente ans en Suisse soit in trouvable ailleurs Actuellement aucun moyen ne per met d authentifier cette accession A l chelle internationale les r seaux se cr ent et les collaborations s intensifient AU sein du programme europ en ax sur la conservation long terme des res sources g n tiques ECPGR European Cooperative Pro gramme for Plant Genetic Resources le projet AEGIS A European Genebank Integrated System a t d ve lopp pour am liorer la conservation des pommes de terre au niveau europ en Un laboratoire cossais a g notyp 433 accessions provenant de huit pays euro p ens dont 25 de Suisse Les r sultats ont t pr sent s au d but de juillet au congr s EAPR European Associa tion for Potato Research Bruxelles http documents plant wur nl cgn pgr AEGISpotato Certains r sultats concernent les anciennes vari t s conserv es en Suisse l exemple de l accession suisse Lauterbrunnen qui a un profil identique celui de la vari t Robjin conserv e au Royaume Uni et en Alle magne cette vari t a d ailleurs t inscrite dans le ca talogue mondial en 1926 par la Hollande Cette acces sion consid r e comme unique jusqu pr sent en Suisse est en fait une vari t de provenance trang re rev tue d une appellation locale En revanche deux accessions locales suisses la Safier et la Rote L tschentaler fig 2 ont un profil identique
3. 2001 par la 31 Conf rence de la FAO le trait est entr en vigueur le 29 juin 2004 Ces documents ont t retravaill s et en 2011 un deuxi me Plan d action mondial a t adopt par le conseil de la FAO Rome I http www fao org do crep 015 i2624f i2624f00 htm Les principales modifi cations portent sur les nouveaux d fis li s au change ment climatique et l ins curit alimentaire et visent tirer profit des nouvelles m thodologies d informa tion de communication et de biologie mol culaire En Suisse A la suite de ces travaux un Plan d action national PAN a t tabli au niveau suisse La coordination entre banques de g nes groupes de travail par plante et utilisateurs est g r e aujourd hui par l OFAG La base de donn es nationale accessible au public a t cr e elle contient toutes les informations sur les res sources concern es par le PAN www bdn ch Les es p ces sont r unies en diff rents groupes arbres frui tiers gramin es fourrag res grandes cultures l gumes l gumineuses fourrag res petits fruits plantes aromatiques et m dicinales et vigne Les principaux buts du PAN sont d inventorier les RPGAA d entretenir les collections existantes et de renforcer les activit s de conservation ex situ mais aussi d assurer une conservation long terme et bien cibl e de ces plantes et de favoriser leur utilisation du rable Un fort accent est mis sur la coop ration entr
4. D autres ces phytog n tiques pourquoi et comment At A nserver le IaentiTier et CO Ss ressources pnytoge encore sont multipli es de mani re v g tative par exemple les tubercules pour les pommes de terre les boutures pour les fraisiers et conserv es ex situ sous forme de boutures in vitro Les vari t s s lectionn es font l objet d une des cription morphologique extensive Avec l av nement du profilage par microsatellites un type de marqueur g n tique il est devenu possible de caract riser g n tiquement les accessions pour certaines esp ces En comparant les profils des accessions de nombreuses erreurs ont t mises en vidence dans le cas de la pomme de terre par exemple plusieurs accessions portant une appellation locale sont en fait des vari t s reconnues officiellement tabl 1 Dans d autres cas plusieurs appellations locales correspondent la m me vari t ainsi huit accessions de pommes de terre bleues Blaue Emmensteg Blaue Fankaus Blaue Hin delbank Blaue PSR Blaue Suti Blaue Uttwil Blaue Zimmerli et Bleue ont t d clar es synonymes de la Blaue Schweden D autres incoh rences peuvent pro venir d erreurs d tiquetage de collecte ou de manipu lations diverses Certains cas toutefois ne peuvent pas tre lucid s par des marqueurs de type microsatel lites notamment les mutations ponctuelles se tradui sant par exemple par des fleurs ou des fruits de couleur inh
5. groupes de recherche ont d progresser de mani re ind pendante pour caract riser leurs vari t s En fonc tion des marqueurs choisis certains appareillages ou modes op ratoires fournissent des r sultats peu com patibles d un laboratoire l autre Ainsi dans certains cas les accessions peuvent tre authentifi es relativement ais ment car il existe des bases de donn es publiques ou d acc s plus restreint qui permettent de confronter les profils g n tiques obtenus avec des marqueurs communs Dans d autres cas le nombre de marqueurs communs est trop faible certains d entre eux ne sont pas compatibles les collaborations pas encore fonctionnelles ou les r sul tats confidentiels et il est donc tr s difficile d authen tifier les accessions De plus de nombreuses vari t s n ont pas encore t g notyp es donc aucun profil n est disponible Identifier et conserver les ressources phytog n tiques pourquoi et comment Agroscope Pour pallier ces difficult s il est possible pour au tant qu elles soient disponibles de commander des vari t s d autres collections et d en effectuer le pro filage afin de confirmer des homonymies par caract ri sation g n tique Cette proc dure se heurte parfois des probl mes par exemple la pomme de terre Welt wunder inscrite sur la liste suisse des vari t s de pommes de terre de 1925 1957 ne figure sur aucune liste internationale Comment se fait il qu une vari
6. Agroscope Identifier et conserver les ressources phytog n tiques pourquoi et comment Eric DROZ Agroscope 1260 Nyon Renseignements Eric Droz e mail eric droz agroscope admin ch t l 41 58 460 44 19 www agroscope ch D d f g 8 a D Ce e z A AA a Figure 1 Diff rents cultivars de pommes de terre au champ photo Carole Parodi Agroscope Introduction L Office f d ral de l agriculture OFAG s est engag pr server et utiliser durablement les ressources phyto g n tiques pour l alimentation et l agriculture RPGAA Ces ressources phytog n tiques se rapportent princi palement d anciennes vari t s autrefois ou margina lement cultiv es dans notre pays mais aussi des va ri t s issues de croisements effectu s en Suisse ainsi qu aux vari t s actuelles Certains faits marquants de cette d marche et de son origine sont rappel s ici Niveau international Un Plan d action mondial PAM pour la conservation et l utilisation durable des ressources phytog n tiques pour l alimentation et l agriculture a t mis en place sous l gide de l Organisation des Nations unies FAO et officiellement adopt par les repr sentants de 150 pays au cours de la quatri me Conf rence tech nique internationale sur les ressources phytog n ti ques qui s est tenue Leipzig D du 17 au 23 juin 1996 Des repr sentants de 155 pays ainsi que des secteurs public et priv ont
7. abituelle des diff rences de forme des feuilles de l habitus g n ral de la plante etc Le travail avec les microsatellites s effectuant par sondage dans le ba gage g n tique une mutation ponctuelle a tr s peu Tableau 1 Vari t s officielles de pommes de terre connues sous une appellation locale La date du Catalogue universel des vari t s de pommes de terre indique l inscription officielle de la vari t Appellation locale Vari t officielle Date Aargauer M sli Ratte 1872 Acht Wochen N deli Ratte 1872 M sli Oberkirch Ratte 1872 Virgule B roche Ratte 1872 Marseille Institut de Beauvais 1884 King Charles King Edward 1902 Behaarte Kartoffeln Allerfr heste Gelbe 1922 Weisse L tschentaler Maritta 1947 Roosevelt Roseval 1950 Mittelfr he L tschentaler Ostara 1962 Vriner D sir e 1962 Lumbrein D sir e 1962 Guarda Christa 1975 Bondo Granola 1975 Walviertler Delikatess Charlotte 1981 Baselbieter M sli Franceline 1993 suisse VITCIC JU well D Vs d IA rboriculture Horticulture Vol 46 6 362 de chances d tre rep r e de cette mani re D autres facteurs peuvent modifier l aspect morphologique des plantes des conditions climatiques extr mes des ca rences en eau ou en min raux et surtout des maladies en particulier les viroses Dans ces cas le profilage est efficace et permet de confirmer l identit d une plante affect e par les
8. actuellement sans quivalent dans l chantillonnage du projet AEGIS Elles restent consid r es comme uniques en attendant de pouvoir tre compar es avec davantage de profils Il arrive aussi que des accessions qui portent le m me nom aient des profils diff rents Les g notypages d chantillons de l tranger et ceux du projet AEGIS montrent que les accessions d Eigenheimer de France d Allemagne et du Royaume Uni sont identiques alors que celles de Suisse et des Etats Unis diff rentes l une de l autre ne correspondent pas aux premi res L chan tillon suisse d montrerait une confusion avec l Erdgold morphologiquement tr s proche tandis qu une acces sion portant le nom local de Tennaer correspond aux accessions europ ennes d Eigenheimer Dans certains cas il est difficile de savoir quel con servatoire poss de la vari t authentique la Rosafolia suisse a un profil identique la Centrifolia anglaise alors qu il existe une Centrifolia suisse avec un profil dif f rent De m me la Voran irlandaise est diff rente de la Voran suisse Le projet AEGIS a trait trois accessions d Alma en provenance de Suisse de Tch coslovaquie et d Allema gne toutes munies de profils diff rents tandis que le catalogue Mondial ne mentionne qu une seule Alma originaire de Tch coslovaquie et inscrite en 1978 De son c t la base de donn es http www plantbreeding wur nl potatopedigree recense quatre cultivars Alma issus de cr
9. cular profiling techniques and emphasis is placed on establishing interna tional collaborations to validate varieties and their genetic profiles Key words biodiversity phytoge netic resources genotyping iden tification conservation Conclusions e Les diff rents cas de figure montrent que chaque Zusammenfassung E Identifizierung und Erhaltung pflanzengenetischer Ressourcen Wie und warum Die Vereinten Nationen haben einen globalen Aktionsplan zur Erhaltung der pflanzengeneti schen Ressourcen f r Ern hrung und Landwirtschaft eingerichtet Die Schweiz als Unterzeichner staat hat einen nationalen Aktionsplan gem ss den interna tionalen Richtlinien entwickelt Die wichtigsten Aktivit ten im Rahmen dieses Plans sind Auf listung der pflanzengenetischen Ressourcen Selektion von Sorten und Akzessionen nach definier ten Kriterien angepasste und nachhaltige Pflege morpho logische Beschreibung sowie ge netische Identifikation und Best tigung der Sortenechtheit Die Bearbeitung von Sorten nach Aktionsplan wurden an unter schiedliche Expertengruppen bergeben welche ber die ent sprechende Erfahrung verf gen Zur sicheren Best tigung der Sortenechtheit mit bekannter Technik zur Erstellung des geneti schen Fingerabdrucks ist der Aufbau von internationaler Zusammenarbeit zwischen den Experten unbedingt erforderlich Riassunto E Identificare e conservare le risorse fitogenetiche perch
10. e nevue SUISSE VITI conserver les ressoui R sum E programmes nationaux et institutions internationales FAO ainsi que sur le partage des avantages et des connaissances L acc s au mat riel g n tique et aux technologies doit tre assur afin de promouvoir les changes de RPGAA Une clause du trait vise aussi confirmer les besoins et les droits des agriculteurs Conservation et identification Une fois l inventaire des vari t s disponibles compl t les diff rents groupes de travail ont d prendre des d cisions afin de d finir les vari t s conserver Les consignes indiquent que les crit res prioritaires sont les vari t s suisses les esp ces sauvages indig nes uti lis es pour l agriculture et l alimentation les esp ces sauvages indig nes prog nitrices de vari t s cultiv es les vari t s trang res ayant un lien avec le patrimoine socioculturel suisse les vari t s trang res rares le mat riel g n tique particulier curiosit s mutants etc et les accessions avec un nom inconnu sans nom ou avec un nom collectif Selon les diff rentes esp ces les types de conserva tion varient beaucoup Les arbres fruitiers et les vignes sont conserv s in situ dans des vergers et des vignobles Les plantes qui sont reproduites par graines comme les c r ales et de nombreux l gumes sont conserv es ex situ sous forme de semences dans la banque de g nes nationale maintenue par Agroscope
11. facteurs pr cit s Authentification Gr ce la disponibilit de marqueurs microsatellites pour plusieurs des esp ces concern es par le PAN le profilage a bien progress notamment pour les ma s les arbres fruitiers les baies les vignes et les pommes de terre Apr s avoir identifi les doublons et autres erreurs en les comparant avec les bases de donn es in ternes la deuxi me tape consiste v rifier au niveau international si les vari t s conserv es dans le cadre du PAN correspondent bien leurs homonymes interna tionaux donc les authentifier et si les accessions profil unique au niveau suisse ou portant une appella tion locale sont bien des vari t s originales valider leur unicit Pour certaines esp ces plusieurs centaines de mar queurs microsatellites sont disposition dans la litt ra ture Au d but de la plupart des projets chaque groupe de recherche a s lectionn une s rie de marqueurs adapt s aux outils disponibles dans son laboratoire et la diff renciation de son chantillonnage de vari t s Pour certaines esp ces un r seau international bien tabli a permis tr s t t de s lectionner un set de mar queurs communs tous les laboratoires chaque labo ratoire compl tant ce set en fonction de ses besoins En revanche pour d autres esp ces notamment celles de moindre importance conomique l tablissement de r seaux prend plus de temps et dans l intervalle les
12. oisements diff rents Allemagne 1904 Hol lande 1928 Tch coslovaquie 1978 et Autriche 1984 Dans ce cas il para t judicieux de maintenir trois acces sions avec des profils diff rents dans les collections europ ennes Toutes ces situations et ces exemples montrent bien que le travail d authentification n en est qu ses d buts Figure 2 Les vari t s suisses Safier et Rote L tschentaler sont identiques mais portent un nom diff rent Revue suisse Viticulture Arboriculture Horticulture Vol 46 6 362 366 2014 Agroscope Identifier et conserver les ressources phytog n tiques pourquoi et comment Summary E Identification and conservation of plant genetic resources why and how The Organization of the United Nations has set up a global action Plan to preserve the biodiversity of plant genetic resources for food and agriculture Switzerland as a signatory has developed its own national action Plan in accordance with international guidelines The main activities related to this Plan are to esta blish an inventory of plant genetic resources select the accessions and varieties according to the defined criteria maintain in appropriate and sustainable ways these varieties describe them morphologically identify and authenticate them These tasks were divided into different groups of experts depending on the species concerned For some species the identification and authentication use mole
13. particip activement l laboration Revue suisse Viticulture Arboriculture Horticulture Vol 46 6 362 366 2014 Identifier et de ce plan mondial qui identifie les activit s prioritaires aux niveaux local national r gional et international et uvre pour une coop ration syst matique ration nelle quilibr e et quitable entre les pays signataires de la D claration de Leipzig issue de cette conf rence http www pgrfa org gpa dza PAM pdf Le plan et la d claration mettent en vidence l im portance des ressources phytog n tiques pour la s cu rit alimentaire et le d veloppement durable qui sont menac es au m me titre que la biodiversit La diversit de ces ressources prend toute son importance face des ph nom nes comme les changements climatiques les nouvelles maladies des v g taux ou les organismes nui sibles en provenance d autres contr es De nouvelles vari t s obtenues en utilisant le bagage g n tique de ces ressources pourraient offrir des solutions ces pro bl mes tout en s av rant durables et productives Un Trait international sur les ressources phytog n tiques pour l alimentation et l agriculture a ensuite t mis en place visant assurer la s curit alimentaire par le biais de la conservation de la biodiversit de l change et de l utilisation durable des ressources phy tog n tiques tout en garantissant le partage des b n fices Adopt le 3 novembre
14. tion d un d p rissement d un accident ou d une erreur d tiquetage e Le profilage g n tique large chelle s av re n cessaire pour authentifier les accessions des diff rents pays et nuancer l nonc des r sultats e Les diff rents groupes charg s de conserver les RPGAA dans le cadre du Programme d action Bibliographie Revue suisse Viticulture Arboriculture Horticulture Vol 46 6 362 366 2014 semblables Les collaborations entre laboratoires internationaux s toffent mais il reste un norme travail d authentification de comparaison et d change de donn es pour optimiser la conservation au niveau mondial S Anonyme 2009 10 World Catalogue of Potato Varieties AgriMedia Pieterse L and Hils U Eds 330 p Vignes 2015 parfaitement prot g es Bayer Schweiz AG CropScience 3052 Zollikofen T l phone 031 869 16 66 www agrar bayer ch Employer les produits phytosanitaires avec pr caution Avant utilisation lire attentivement le mode d emploi et les informations sur l tiquette Observer les phrases et symboles de danger etles valeurs s res Basta Cyrano Envidor Flint Kocide Opti Melody combi Mildicut Milord Moon Experience Moon Privilege Movento Arbo Ocarina Prodigy Profiler Prosper Sico Teldor
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