Introduction `a R
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1. Directory getwd n afficher le nom du fichier d initialisation cat paste Profile file Sys getenv R_PROFILE n Daniel Herlemont 2 4 ANNEXE charger automatiquement des packages utiles library tseries chargement de mon code source perso si util R contient des fonctions perso on pourra ajouter la ligne suivante source util R 1 4 Acc s internet depuis R Pour effectuer les t l chargements cours sur YAHOO par exemple il faudra si besoin pr ciser l adresse du proxy dans le raccourci de lancement de R Rgui exe http_proxy addresse du proxy 2 D couverte Au premier d marrage de R faire un tour de reconnaissance de l environnement dans les menus l aide en ligne HTML les manuels pdf ex cuter quelques d mos commande demo exemple demo graphics Si RMetrics est install ex cuter les d mos de fBasics voir la pr sentation la fin du document 3 Le langage et les graphiques refaire les manipulations les plus simples de la pr sentation sur le langage vecteurs listes matrices 4 Annexe 4 1 Installation des logiciels 4 1 1 Installation WINDOWS T l charger la distribution ainsi que les packages utiles partir de l adresse http cran cict fr bin windows base Daniel Herlemont 3 4 ANNEXE CRT LEF DII AISSA EIU erne eei niena 8 Setup R for Windows E mjel Ea Select Components Which components should2. Instal package s from CRAN Installer via internet depuis le site CRAN Jostal packages Tom local 4 Ses Menu gt Packages Install packages from CRAN lt Update packages from CRAN E Instal package s from Bioconductor S lectionner le package installer Update packages from Bioconductor puis OK exemple installation de tseries un package pour les Time Series Vous pouvez v rifier que le package a bien t int gr a la liste des packages cf load T l chargement package dans l aide en ligne URL ran rproject orgbinwindomscontib Atseries_0 5 17 20 u ws tep Coracle E FAQ cnR package tseries successfully unpacked and MDS sums checked FAQ ONR for Windows Urus Delete downloaded files y m R pondre yn Pour utiliser un package d j t l charg et install il faut le charger dans l espace de travail par menu cf tape 0 ou par ligne de commande gt library fseries 1 protect do A faire chaque session de travail vous pouvez aussi sauvegarder votre espace de travail en quittant R auquel cas cette tape sera inutile et vous pouvez commencer utiliser le package juste apr s lancement de R A priori l installation du package n est faire qu un seule fois a moins d une mise jour du package qui justifie un nouveau t l chargement 11 Daniel Herlemont 5
3. Introduction R Daniel Herlemont Table des mati res 1 Getting Started 1 LL Installation et Ex cution o 2 4 od 124 64 seb daded LARGES 4 1 12 Repertore de travail ie Le si mace na Be dde D die Wire die Wie dx 1 ko Mitalsations sii e sas a e a aa e e a aa e a a a Ea a EA e i 2 LA Accesa internet depuis R Lane De pe p dnp oe p Ea De d ee Gi 2 2 D couverte 3 3 Le langage et les graphiques 3 4 Annexe 3 A l Tnstallation des logiciels e lt s so esorta sceo aos oio a Sonia a 3 ALL Installation WINDOWS s s s ee ose ste de u ote aos sibe ioste 3 412 Installation De o a s ia aet a ha a a a a a a ani 4 Als Tnstallation d un package sirs eus dd die e id a eia AE pas 4 L objectif de ce TP est de se familiariser avec R personnaliser son environnement ap prendre les bases du langage R quelques fonctions graphiques et statistiques l mentaires 1 Getting Started 1 1 Installation et ex cution Si ce n est d j fait installer R en t l chargeant la derni re version disponible sur le site http cran r project org voir 4 1 pour plus de d tails Dans la suite nous supposerons que R est install dans le r pertoire install dir par exemple c R rw2001 1 GETTING STARTED Sous Windows on pourra ex cuter directement install dir bin Rgui exe La f n tre R doit alors appara tre 1 2 R pertoire de travail On pourra si on le souhaite configurer son environnement pour plus de confort cr er un r p
4. be installed R Selectthe components you want to install clear the components ou do not want to install Click Next when you are ready to continue Minimal user installation v Main Files o Compiled HTML Help Files 3 2 MB C HTML Help Files 7 5 MB C Latex Help Files 2 4 MB C On line PDF Manuals 2 0 MB C Reference Manual 5 3 MB C Source Package Installation Files 1 1 MB C Support Files for libraryttcltk 5 2 ME Current selection requires at least 16 7 MB of disk space lt Back Cancel 4 1 2 Installation Linux Dans le cas d une installation sur plateforme Linux voir le mirroir fran ais http cran cict fr Il est possible d installer les binaires pour diff rentes cibles ou partir du source Selectionner la version stable La proc dure d installation est relativement classique se munir ventuellement du du manuel d installation et d administration http cran cict fr doc manuals R admin pdf 4 1 3 Installation d un package L installation des diff rents packages se fera directement sous la console R par t l charge ment depuis le menu Packages Install Package s from CRAN On pourra alors installer les packages suivants tseries et facultatifs comme evd VaR Daniel Herlemont 4 4 ANNEXE Installer et utiliser un package Voir si le package est d j install H l Packages Windows Hep Si oui inutile de le t l charger nouveai Load package E passer en 5 u
5. ertoire de travail exemple c rwork cr er un raccourci sur bin Rgui exe par un clic droit sur le raccourci modifier le param tre D marrer en pour indiquer le dossier de travail choisi c rwork dans cet exemple Lancer R en cliquant sur le raccourci la console R doit appara tre v rifier que le r pertoire de travail avec la commande getwd on peut aussi modifier ce repertoire l aide de la commande setwd Ainsi lorsque vos quitterez R par la commande q par exemple vous pourrez sauve garder le travail en cours en r pondant oui la question Save work space image Votre environnement toutes vos donn es et fonctions sont alors sauvegard s dans le fichier RData dans le r pertoire de travail Cet environnement pourra tre charg lors de la prochaine ex cution et vous pourrez reprendre le travail en cours comme si vous n aviez pas quitt R 1 3 Initialisations On pourra d finir un fichier RProfile afin d effectuer des taches r p titives au d marrage Pour cela cr er un fichier c rwork rprofile txt par exemple Ajouter R_PROFILE c rwork rprofile txt dans le champ cible du raccourci sur la ligne contenant RGu i exe Editer ce fichier puis entrer les commandes que vous souhaitez ex cuter lors du d marrage exemple afficher le repertoire d installation cat paste R Home Sys getenv R_HOME n afficher le repertoire de travail cat paste Working
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