Home

NSIHwin Manuel du Module d`importation

1. pour l importation d interventions chirurgicales la d termination automatique de la cat gorie d op ration NHSN sur la base du code de proc dure ICD 9 CM ou le calcul automatique de la dur e d op ration sur la base du moment de d but et de fin de l op ration ou le calcul automatique de l indice de risque NHSN pour l importation des interventions chirurgicales la conversion de donn es sp cifiques la proc dure chaque observation est une proc dure ICD 9 CM sur un patient et une date en donn es sp cifiques l intervention chaque observation est une intervention ou un ensemble de proc dures sur un patient et une date la cr ation automatique de donn es de d nominateur sp cifiques l h pital ou l unit sur la base des donn es d admission et de sortie des patients En cliquant sur le bouton User specific field categories l cran Field Category Conversion appara t Celui ci affiche la liste des champs cat gorie field name sp cifiques pour la d finition d importation avec les codes autoris s Default category gt et les descriptions Category description La liste d roulante Categorical fields permet de filtrer cette liste pour un champ cat gorie sp cifique Pour chaque cat gorie s par e ce formulaire permet de compl ter dans la colonne User category le code qui doit tre utilis dans les donn es importer Cocher Convert User Categories e
2. admisdticu date d admission en soins intensifs du patient Les informations combin es de ces trois champs identifient alors de fa on unique chaque ligne du tableau tblicu data En ouvrant le tableau interm diaire bouton Open gt on observe en effet que la colonne icu_id0 est encore vide mais que les colonnes hopidn idn et admisdticu sont pr sent compl t es icu_idO peut tre compl t automatiquement l aide d une proc dure de mise jour voir pour cela les explications et l exemple au point 3 3 b i Qry_LinkErrors Select Query TestDate Tablellame Fiel llame DN RECORDNO 07 04 2004 linkthlicu_datai Icu_DIS_ST4 497021 alive is not a valid category for this field 07 04 2004 linkthlicu_datai Icu_DIS_STA LL alive is not a valid category for this field 04 2004 linkthlicu_datai ICU_IDO A 4 ais value is required 2004 linkthlicu_datai ICU_IDO F 42 viS is required O4 linkthlicu_data1 ICU_IDO 437568 43 quired O4 linkthlicu_data1 ICU _IDO qe quired O4 linkthlicu_datai ICU_IDO F 45 quired 004 linktblicu_data1 ICU_IDO 294763 46 S s required 2004 linktblicu_datai ICU_IDO 47 is is required 2004 linkthlicu_datai ICU_IDO 45 is is required 2004 linkthlicu_datai ICU_1DO h 49 quired 07 04 2004 linkthlicu_datai ICU_IDO 476410 50 This value is required 07 04 2004 linktblicu_data1 IDN 264763 H A64763 must be present in tblPatient IDN N7114 2004 linkthlicu_dat
3. icu dis sta dans les donn es interm diaires dans la d finition d importation pour ICU Admissions E NSiHwin Field Category Conversion Field name Default Category User category description category D 2722212222 SN D 2 2 D D A A 2 D A 1 D Figure 3 3 b 5 correction des valeurs de cat gorie pour le champ origin n dans les donn es interm diaires dans la d finition d importation pour ICU Admissions o la cr ation automatique des codes h pital admission et unit dans leurs tableaux de r f rence sp cifiques peut tre ex cut e via des proc dures de mise jour appends missing hopidn values to tblhospital appends missing IDN values to ftblpatient et appends missing unitO values to tblhopunit gt o l assemblage automatique du champ licu_id0 peut tre ex cut via la proc dure fill icu _id0 where empty En cochant les 4 proc dures de mise jour dans la liste de l onglet correct intermediate data et en cliquant sur Run selected figure 3 8 b 6 les donn es interm diaires de la figure 3 8 b 7 sont affich es on peut y voir que la colonne ICU_IDO est pr sent compl t e Une fois de retour dans l onglet Intermediate data cliquez sur Test la suite de quoi le message Intermediate data table f linktblicu_ data tested 0 errors appara t 23 E NSlHwin Import Definitions 1 IMPORT DEFINITION Definition
4. SWDELEG date Number 1 Number2 OPNNISLabeli OPNNISLabel2 OPNNISLabel3 OPBEGINS OPENDS OPDURAT OPCONTAMCL OPCONTA 5 DEMI SWIAB_CODE SWIAB_ADOT B P T a CT Figure 3 1 3a Rapport NSIHwin table relations pour les tableaux utilis s dans la surveillance SSI Si des donn es doivent tre import es via diff rentes d finitions d importation celles ci peuvent tre fournies partir d une feuille MS Excel unique Chaque d finition d importation ne retiendra que les colonnes sp cifiques pour son tableau de destination Si des doubles observations sont constat es chaque d finition d importation a galement la possibilit de d doubler les donn es d importation Exemple de surveillance SSI Pour l importation d interventions chirurgicales il est possible de pr parer dans un seul fichier Excel les donn es relatives aux interventions cat gorie d op ration classe de l sion et aux patients nom de famille date de naissance puis de les importer via les d finitions d importation pour les admissions des patients thlpatient et les interventions chirurgicales tolswiinter Les patients qui ont subi plusieurs interventions pendant leur s jour appara tront par cons quent plusieurs reprises dans le fichier source et peuvent lors de l importation tre d doubl s dans le tableau pour les admissions des patients Cette compilation de donn es de d nomina
5. es 11 99 0 14 2008 04 01 2008 09 10 04 01 2008 09 40 53 59 0 4111 111 9333 99 UU ILVO U4 U I UUOQ VO lt D UKU 1 ILUVO VO 49 922 UZ D I W 2008 04 01 2008 09 10 04 01 2008 09 40 xl L 008 02 01 2008 09 35 02 01 2008 10 10 B 2008 02401 2008 09 35 02401 2008 10 10 53 4 B M 9333 ZT UZ UT ZUUS UZIUT ZUUS VJ UU UZA ZUG 11 19 51 4 aaaa an ATMA NNNNA ATNA NNNNA 144 N5 ATNA NNNNA 479 AN SA 1 1 1 a Figure 3 3a doubles observations dans la liste comprenant les donn es d intervention o Dans l onglet Intermediate data figure 3 3b il convient de cliquer sur le bouton Import pour transf rer les donn es d intervention du tableau d origine vers le tableau interm diaire Pour d doubler les observations voir point pr c dent il faut s assurer que l option remove double obs before import est coch e La confirmation 24 records imported appara t ce sont 2 observations de moins que les indications initiales dans le tableau Excel ce qui t moigne de la proc dure de d doublement En cliquant sur Open les donn es du tableau interm diaire sont affich es l cran figure 3 3c on observe pr sent les donn es d intervention avec une s rie de colonnes vides parce que les donn es pour ces champs n ont pas t propos es dans la liste Excel E NSIHwin Import Definitions 1 IMPORT DEFINITION Definition Protocol Destination table Table Field tbiswinter v Fiel
6. sp cifiques Proc dure de mise jour where missing sets _id0O _ref0 where missing appends hospital code to table tblhospital where missing appends ward codes to tlkoward appends unit_id values to tblhopunit if missing where missing appends patient admission codes to tblpatient delete lines with missing mandatory variables where missing appends cultures to tbl mo Append mandatory AMR markers where empty where missing sets priorcode Surveillance NSIH ICU Importation des donn es du d nominateur via la d finition ICU level 1 Denominators tblicu Lideno Proc dure de mise jour transforms patient ICU Description Assemble les champs cl s obligatoires _id0 ou _ref0 sur la base de champs individuels qui forment ensemble une observation unique D finit le code h pital dans le tableau de r f rence tblhospital si celui ci n existe pas encore D finit le code ward dans le tableau de r f rence tlkpwardl si celui ci n existe pas encore D finit le code unit dans le tableau de r f rence tblhopunit si celui ci n existe pas encore D finit les num ros d admission des patients dans le tableau de r f rence tblpatient s ils n existent pas encore Remarque Si des variables sp cifiques au patient et des facteurs de risque comme le nom l ge et le sexe doivent tre import s la d finition d importation pour le tableau tblpatie
7. swil_id0 figure 3 3f Une proc dure automatique permettant de corriger automatiquement la valeur manquante dans les tableaux mentionn s voir plus loin la figure 3 3b est ici aussi pr vue Microsoft Office Access Intermediate data table linktblswinter1 tested 192 errors Figure 3 3d importation des donn es d intervention dans le tableau interm diaire E Qry_LinkErrors Select Query 240772010 h_code 15 56740 9999 must be present in thlhospital hopidn gt H 12 07 2010 linkthiswiinter1 h_code 16 56741 9999 must be present in thlhospital hopidn 12407 2010 linktbhlswiinter1 h code 19 56742 9999 must be present in thlhospital hopidn 12407 2010 linkthlswinter1 IDN 15 56740 5 must be present in tblPatient IDN 12 07 2010 linktblswiinter1 IDN 16 56741 6 must be present in thlPatient IDN 4907040 linkthlssniinter1 INAI 1a SR74 40 mist he nresent in thlPstient INN 12407 2010 linktblswiinter1 OPSURG1 15 56740 S must be present in tlkpswisurg surgeon_ init 1227 2010 linktblswiinter1 OPSURG1 16 56741 C must be present in tlkpswisurg surgeon_init 12 07 2010 linkthiswinter1 OPSURG1 19 56742 C must be present in tlkoswisura suraeon init Figure 3 8e validation des donn es d intervention valeur manquante h_ code dans tblhospital valeur manquante idn dans tblpatient valeur manquante opsurg1 dans tlkpswisurg 20 3 3 2 E Qry_LinkErrors Select Query 1227 2010 linkthlswinter1 I
8. 01 2005 03 01 2008 03 01 2008 03 01 2008 03 01 2008 04 01 2005 04 01 2008 04 01 2008 04 01 2008 04 01 2008 04 01 2005 04 01 2008 05 01 2008 07 01 2008 07 01 2008 02 01 2008 08 30 02 01 2008 08 30 02 01 2008 08 30 02 01 2008 08 15 02 01 2008 09 35 02 01 2008 09 35 02 01 2008 10 20 02 01 2008 11 20 02 01 2008 09 00 02 01 2008 13 35 02 01 2008 14 30 02 01 2008 15 45 03 01 2008 14 40 03 01 2008 16 45 03 01 2008 11 15 03 01 2008 13 00 04 01 2008 08 45 04 01 2008 08 25 04 01 2008 09 10 04 01 2008 09 10 04 01 2008 08 50 04 01 2008 11 04 04 01 2008 13 05 05 01 2008 09 30 07 01 2008 08 50 07 01 2008 11 05 79 M 4 gt m Sheet2 Sheet3 Ready 0201 2008 10 30 45 75 0201 2008 10 30 45 76 0201 2008 10 30 46 13 0201 2008 08 42 53 04 0201 2008 10 10 53 41 02 01 2008 10 10 53 41 0201 2008 10 51 53 05 02 01 2008 12 00 53 03 0201 2008 11 15 81 54 0201 2008 14 50 81 53 02 01 2008 16 04 81 52 02401 2008 17 25 81 51 03 01 2008 16 40 45 76 03 01 2008 18 52 81 52 03 01 2008 13 10 80 51 03 01 2008 14 55 80 51 0401 2008 10 45 45 76 0401 2008 08 45 53 02 04 01 2008 09 40 53 59 0401 2008 09 40 53 59 0401 2008 10 23 81 54 0401 2008 12 34 81 51 0401 2008 14 50 03 09 05 01 2008 10 35 80 51 0701 2008 10 00 80 51 0701 2008 12 25 80 51 00000 OTTDEO0OO0OEOONOOTTDTUTTDErErX IN IN EN ON LN LN LN EN EN NN EN NN IN LN NON ON NON ON ON ON LNR Sum 261344 SA ot St CO ON ON EN ON ON ON EN ON ON ON ON ON CN CN EN 1 Os O
9. 14072010 linkthlicu_datai ACMISCTIEU 440735 33 4 60P200 has no regular Date format CRETE TES CRE LOI LOT RS LE LE RL CLS LE LES LE TE Pe IL T4 LEa a L a a a CRE LES Ipee I T A ANT A Pl Felde ele mimi AR Wol mm la e mem Li mom ml le momimle 14072010 linkthlicu_datai ASF7566 32 22 has no regular Integer format A ANT A M BTE ms el 4 2 h A a d lAl mom la m nnm m h m ball ia l mL 1 EESTE E TTET TEE S Ee T i gn a ann e eei we r COTE ET D DUR ST OMIS TR TUE DOUCE RU UT Figure 3 8 3 Liste Linkerrors avec les erreurs de validation s lectionn es pour le champ date admisdticu et saps_tot en bas O Dans la liste Linkerrors figure 3 3 a 4 il importe d examiner les lignes pour le champ icu_ dis sta il s av re ici que les valeurs utilis es ne correspondent pas aux cat gories autoris es pour ce champ Il convient alors d ouvrir le rapport Field Categories en cliquant sur le bouton On peut voir en page 4 de ce rapport que les donn es de sortie alive et died correspondent respectivement aux cat gories 1 et 2 La figure 3 3 a 5 illustre ensuite les erreurs de validation pour le champ cat gorie origin_n dans lequel survient le m me probl me que pour le champ icu_dis_sta savoir que les valeurs trouv es dans ce champ ne co ncident pas avec les cat gories d finies Ici aussi il est possible de v rifier dans le rapport Field Cat gories quelle
10. A AIT ANA N 4 C4 NA Record 14 4 10 gt Pij of 13 22 Figure 3 3 b 3 Correction des donn es interm diaires dans la d finition d importation pour SSI Interventions Exemple de surveillance ICU suite lors de la validation des donn es d admission aux soins intensifs ICU dans le tableau interm diaire il s est av r que les champs u dis sta et origin n ne contenaient pas les cat gories ad quates que le champ icu_id0 devait encore tre assembl et que les codes h pital patient et unit devaient encore tre enregistr s dans les tableaux pr vus cet effet Ces actions peuvent tre ex cut es automatiquement gr ce quelques proc dures automatiques o les champs icu dis sta et origin _n peuvent tre nouveau encod s en cliquant sur le bouton User specific field categories et ensuite pour les lignes du champ icu dis sta en compl tant dans la colonne user category alive pour 1 died pour 2 et pour le champ Origin _n en remplissant dans la colonne user category other pour 1 et community pour 3 figure 3 3 b 4 et 3 3 b 5 E NSIHwin Field Category Conversion Categorical fields icu_DIS_STA Field name Default Category User category description category DEuDSSA OO jossa p paw D jossa p peenem O pss SE ES Figure 3 3 b 4 correction des valeurs de cat gorie pour le champ
11. Exemple de surveillance SSI suite pour chacune des erreurs de validation qui sont apparues au niveau des donn es d intervention dans le tableau interm diaire voir exemple dans 3 3 a nous examinons comment les r soudre via les proc dures de mise jour dans la d finition pour l importation des interventions chirurgicales La figure 3 3 b 8 reproduit de fa on d taill e ces proc dures de mise jour o La s rie d erreurs avec la description 9999 must be present in tblhospital hopidn indique que le code h pital 9999 dans le champ h_ code du tableau interm diaire n a pas encore t enregistr dans le champ hopidn du tableau de r f rence associ tblhhospital Cet enregistrement peut tre ex cut automatiquement en s lectionnant la premi re proc dure de mise jour avec la description appends missing f h_ code to table ftblhospital La s rie d erreurs avec la description must be present in tblpatient IDN indique que les codes d admission l h pital dans le champ idn du tableau interm diaire n ont pas encore t enregistr s dans le champ idn du tableau de r f rence associ tblpatient Cet enregistrement peut tre ex cut automatiquement en s lectionnant la troisi me proc dure de mise jour avec la description appends missing idn to table ftblpatient gt La s rie d erreurs avec la description must be present in tlkpswisurg surgeon_init indique que les codes chirurg
12. Figure 3 4 3 confirmation de l importation des donn es d intervention Suggestions concernant cette proc dure d importation Les exemples ci dessus montrent qu une proc dure d importation est un processus tr s lourd quand la structure de la base de donn es et le format des donn es ne correspondent pas au tableau de destination NSIHwin auquel les donn es sont destin es La plupart des erreurs de validation sur les donn es source et interm diaires section 3 3 peuvent tre vit es en tenant compte des sp cifications dans les rapports Table Fields et Field Categories pour chaque tableau importer D autres erreurs de validation par ex omission de champs cl s ou doubles observations peuvent tre r solues dans la proc dure d importation elle m me l aide des proc dures automatiques Nous conseillons avant de lancer une proc dure d importation de v rifier la pertinence de celle ci vu la complexit et le volume du fichier Par exemple r aliser l importation d un fichier avec 5 Septic mies est beaucoup moins pertinent que l importation d un fichier comprenant 150 donn es de patients En effet il est probable que l encodage manuel du premier fichier n cessitera moins de temps que la r alisation de la 30 proc dure d importation 31
13. Protocol Destination table Table Field tblicu_data v Fields Categories Open ja Source data Intermediate data Correct intermediate data Destination data 3 CORRECT INTERMEDIATE TABLE Correction B Query Description Last Run Run selected 1 ary inktbliC w appends missing hopidn values to tblhospital 2 ary _linktblic se appends missing IDN values to tblpatient 3 ary_linktibic se appends missing unitO values to tlhopunit D A LE 0 ary _linktblic se delete lines with missing mandatory variables Se Figure 3 3 b 6 correction des donn es interm diaires dans la d finition d importation pour ICU Admissions linktblicu_dataf Table MIE icu Do 1oN BED NR DMSDTICU unito leu DIS DT leu DIS_STA SAPS_TOT APA_TOT P SCORE origin n 2 67 9999 41 5686 1601 2004 415686 16 01 2004 17 01 2004 9999 4537566 25 01 2004 437568 25101 2004 9999 440735 16 01 2004 440735 16 01 2004 19 01 2004 9999 448769 1 2 01 2004 445769 12301 2004 20 01 2004 9999 456902 23 01 2004 456902 23101 2004 27 01 2004 9999 464763 04 01 2004 464763 04 01 2004 5 01 2004 9999 47841 0 2901 2004 475410 29 01 2004 9999 486398 1 0 01 2004 4286398 10 01 2004 16 01 2004 9999 494763 02 01 2004 494763 02 01 2004 4301 2004 9999 497021 1 9 01 2004 497021 19 01 2004 24 01 2004 ES ES ES ES EN PAT PSS PSS AN EX Figure 3 3 b 7 tableau interm diaire avec les admissions ICU avec champ licu_id0 compl t
14. colonnes Protocol et Info indiquent respectivement le protocole SEP pour Septic mies hospital wide ICU pour Infections en soins intensifs et SSI pour Infections du site op ratoire ALL pour les tableaux utilis s collectivement et une description des informations qui doivent tre conserv es dans le tableau de destination La colonne Last import contient la date de la derni re importation dans le tableau de destination et la colonne Records le nombre de lignes import es cette date E NSlHwin Import Definitions List Import Definitions Available Hospital admissions tblPatient Open Hospital names and codes tblhospital Hospital wards tlkpward Relations level 1 Denominators tblicu_Lideno level 1 2 Infections tblicu_bacs 22 10 2010 level 1 2 Microorganisms and AMR m tblicu_mo_ab 22 10 2010 level 2 ai 1 ICU admissions tblicu_ data level 2 a day by day data tblicu_L2dbdA level 2b Catheter Follow up tblicu_L2cat level 2c Anti Microbiological Treatment tblicu_LZamt Figure 3 1 2 Fen tre Import Definition List contenant les d finitions d importation disponibles La d finition d importation du tableau de destination thblicu_ data est s lectionn e Le choix d une d finition s effectue en s lectionnant dans la liste des d finitions d importation la ligne comprenant le tableau de destination applicable aux donn es externes que l on souhaite importer Il co
15. de champs colonnes que le tableau d origine le tableau interm diaire est en effet une copie exacte du tableau de destination qui contiendra finalement les donn es d importation et joue le r le de tableau interm diaire pour valider et ventuellement modifier les donn es d importation avant qu elles ne soient import es d finitivement Le tableau interm diaire contient cet effet tous les champs qui sont galement pr sents dans le tableau de destination En utilisant la barre de navigation horizontale il est galement possible de v rifier les champs icu_dis_ dt icu dis sta en origin n En navigant tout fait droite on observe que les deux derniers champs sont sp cifiques pour le tableau interm diaire recordno est le num ro de la ligne du tableau interm diaire il est utilis pendant la validation de ce tableau pour identifier les lignes non valid es errors est le nombre d erreurs de validation dans chaque ligne qui correspond encore 0 pour chaque ligne dans un nouveau tableau interm diaire import 5 linktblicu_dataf Table MALE __ icu 100 hopian IDN __ 8ED_NR DMSDTICU unito leu DIS_DT icu_DIS_STA SapS_TOT Pa TOT P_SCORE origin n CL_ADMI D 415686 16 01 2004 1701 2004 community 437568 25101 2004 community 440735 16 0P 2004 1920172004 other 445769 12 01 2004 20 01 2004 other 456902 23101 2004 27101 2004 community 464763 04 01 2004 5 01 2004 othe
16. 1 2008 09 10 04 01 2008 09 40 Record JI 2 gt PIP of 24 0000000 lt 00000000000C00c00CooCoo OIO0OO0NI210101 0 0 1 1 101 10100010 10101010 0 W N N 0 0 w IOINIOINIR 2INI IN IN OO G mm ml fa fad fad Figure 3 3 b 9 tableau interm diaire adapt avec les donn es d intervention les champs d finis automatiquement sont encadr s en rouge Exemple de surveillance SSI suite o En cliquant sur Test gt dans l onglet Intermediate data le r sultat 1errors est obtenu Il s agit d une nouvelle erreur qui est survenue cause de la disponibilit du champ cl swil_ido qui est utilis pour v rifier les doubles observations dans le tableau interm diaire Il s av re apr s contr le qu il est question d un patient avec le code 58 qui a subi la m me date une s rie de 3 proc dures appartenant la cat gorie d op ration COLO d sign e via 3 lignes dans le tableau interm diaire avec les codes ICD 9 CM 45 75 45 76 et 46 13 dans la colonne opcode1 figure 3 3 b 10 Ces 3 proc dures sur le m me patient devraient tre group es en une seule intervention Les champs opcode1 opcode2 opcode3 pourraient ainsi contenir jusqu 3 codes ICD 9 CM de cette intervention et les champs opnnis1 opnnis2 opnnis3 les cat gories d op ration correspondantes Cette conversion de la proc dure et des op rations d un format vertical un format
17. 3 01 2006 14 40 03 01 2008 16 40 9993 551 9999 65 04 01 2008 1 65 04 01 2008 45 76 COLO 04 01 2006 08 45 04 01 2008 10 45 nn Sc ON CE NAMA MINS 4 cc NA NS on ei I hA NA NNN 4 2 NN NM MNNS 4 4 CE Figure 3 3 b 10 erreur de validation sur une observation apparemment double pour le patient pr sentant le num ro d admission 58 et les lignes correspondantes dans le tableau interm diaire 26 MIA E linktblswiinter1 Table wipo Jon inremno nrenor OPCODE1 OPCODE2 OPCODES OFNNIS1 OPNNIS2 OPNNIS3 551 9999 52 02 01 12008 1 551 9999 54 02 01 2008 1 02012008 02012008 02101 2008 03101 20085 551 9999 58 02 01 2008 41 231 9999 53 03 01 2005 1 A 231 9999 65 04 01 12005 1 0401 2008 EE 231 9999 66 03 01 12005 1 GE 03 01 2005 Record aja 135 CR CI CE of 22 Figure 3 8 b 11 donn es d intervention transform es apr s l ex cution de la proc dure ICD9 CM code horizontalize option 1 3 3 3 Description des proc dures de mise jour disponibles Cette section contient une description des proc dures de mise jour disponibles Quelques unes d entre elles ont d j t d crites dans la section pr c dente Les proc dures relatives la cr ation automatique de donn es de d nominateur n ont pas encore t mentionn es mais peuvent s av rer utiles Proc dures g n riques Elles sont utilis es dans plusieurs d finitions d importation pour corriger ou compl ter des champs
18. 3 01 2006 16 52 05 01 2008 10 35 HER me a e opdurat_n OPCONT E ssl 04 01 2008 04 01 2006 08 25 04 01 2008 08 45 04 01 72008 i 04 01 2008 09 10 04 01 2008 09 40 Record 4J 9 PP of 24 Figure 3 3c tableau interm diaire avec les donn es d intervention import es o Une fois que les donn es importer se trouvent dans le tableau interm diaire elles sont pr tes tre valid es Il suffit pour cela de cliquer sur le bouton Test La confirmation intermediate data table tested 192 errors figure 3 3d appara t et l cran comprenant les d tails de toutes les erreurs de validation s affiche Il s agit de 2 types d erreurs de validation celles ci sont reproduites par type dans les figures 3 3e et f value must be present in tablename fieldname ou les valeurs du champ ne sont pas pr sentes dans les tableaux de r f rence associ s cela vaut pour le contenu du champ h_code qui n appara t pas dans thlhospital les valeurs du champ idn qui n apparaissent pas dans ftblpatient et les valeurs du champ opsurg1 qui n apparaissent pas dans tlkpswisurg figure 3 3e Une proc dure automatique permettant d ajouter automatiquement la valeur manquante dans les tableaux mentionn s voir plus loin la figure 3 3b est pr vue pour chacun de ces champs This value is required ou valeur manquante dans les champs obligatoires cela vaut pour le champ interno opnnisi opdurat_n
19. 3 3 3 3 1 chirurgicales destin es tre import es dans le tableau tblswiinter o Dans l cran affichant la liste des d finitions d importation figure 3 1 2 s lectionnez la ligne avec la d finition SSI Surgical Intervention tbiswiinter et cliquez sur open L onglet Source data s ouvre ensuite automatiquement dans l cran import definition pour le tableau tblswiinter o Cliquez sur upload et s lectionnez alors le fichier Excel ProcData6a xls dans le sous fichier NSIHwin v40 import Le message de confirmation de la figure 3 2 5a table xls_thlswiinter tested 0 unmatched fields found click errors appara t Cela signifie que les donn es Excel ont t import es et qu aucun champ ne correspondant pas au tableau de destination thlswiinter n a t trouv o En cliquant sur open dans l onglet source data la liste import e des donn es d intervention appara t II est pr sent possible de v rifier si le nombre d observations et les champs co ncident avec la liste Excel Cette liste sera utilis e comme base pour valider et corriger les donn es dans 3 3 Microsoft Office Access Table xls_tblswinter tested 0 unmatched fields Found click Errors Figure 3 2 5a importation des donn es d intervention Excel confirmation de l importation MES xls thlswiinter Table 15 02 01 2008 16 04 01 2008 19 04 01 2008 20 03 01 200
20. 8 21 02 01 2008 24 02 01 2008 24 02 01 2008 30 07 01 2005 31 07 01 2008 35 02 01 2008 45 02 01 2008 52 02 01 2008 54 02 01 2008 58 02 01 2008 58 02 01 2008 58 02 01 2008 59 03 01 2008 65 04 01 2005 66 03 01 2005 67 04 01 2005 72 02 01 2008 75 03 01 2008 90 05 01 2008 95 04 01 2005 99 04 01 2005 99 04 01 2008 02 01 2008 08 15 04 01 2008 11 04 04 01 2008 08 50 03 01 2008 11 15 02 01 2008 09 00 02 01 2008 09 35 02 01 2008 09 35 07 01 2008 11 05 07 01 2008 08 50 02 01 2008 10 20 02 01 2008 15 45 02 01 2008 11 20 02 01 2008 13 35 02 01 2008 08 30 02 01 2008 08 30 02 01 2008 08 30 03 01 2008 14 40 04 01 2008 08 45 03 01 2008 13 00 04 01 2008 13 05 02 01 2008 14 30 05 01 2008 16 45 05 01 2008 09 30 04 01 2008 08 25 04 01 2008 09 10 04 01 2008 09 10 02 01 2006 08 42 04 01 2008 12 34 04 01 2008 10 23 03 01 2006 13 10 02 01 2008 11 15 02 01 2008 10 10 02 01 2006 10 10 07 01 2008 12 25 07 01 2008 10 00 02 01 72006 10 51 02 01 2008 17 25 02 01 2006 12 00 02 01 2006 14 50 02 01 72008 10 30 02 01 2006 10 30 02 01 2008 10 30 03 01 2006 16 40 04 01 2008 10 45 03 01 2008 14 55 04 01 2008 14 50 02 01 2008 16 04 03 01 2006 18 52 05 01 2008 10 35 04 01 2008 06 45 04 01 2006 09 40 04 01 2008 09 40 B C c D B B D D B C B C A A A A A D D C C D B B B 0 00 90 9 0 0 0 0 0 0 90 0 090 0 0 090 0 0 0 0 0 0 1 hopian ian imert opbesns opens opeodet opsurgt
21. DN b 07 04 2004 linktblicu_data1 origin_n 464763 51 other is not a valid category for this field O4 linkthlicu_data origin_n 44073 2 other is not a valid c for this field O4 linkthlicu_datai origin_n 6 i community is not a gory for this field O4 linkthblicu_data1 origin_n 5 other is is O4 linkthblicu_data origin_n f 16 communit O4 linkthlicu_data origin_n 49476 j other is not as 004 linktblicu_data1 origin_n F 5 other is not a valid cate 2004 linkthlicu_datai origin_n F 58 other is not a valid category for this 5 field 2004 linkthlicu_datai origin_n 59 community is not s ategory for this field 07 04 2004 linkthlicu_datai origin_n 276410 60 other is not a valid category for this field FA 07 04 2004 linkthlicu_datai S4PS TOT A375868 53 227 has no regular Integer format Record 14 4 121128 IE of 22 Figure 3 3 a 5 Liste Linkerrors avec erreurs de validation s lectionn es pour le champ cat gorie origin_n o dans la liste Linkerrors Figure 3 3 a 6 on observe que dans les lignes avec les erreurs de validation pour le champ cl icu_id0 le champ requis n a pas t compl t Dans le rapport Table Specification il est indiqu dans la description de ce champ colonne description hopidn idn admisdticu ce qui signifie que ce champ se compose des informations des champs hopidn code h pital idn code d hospitalisation du patient et
22. IOFAN S P Bi 54 9999 90 07 41 2008 07 0t 2008 0201 2008 2012000 SELS 07 0 006 1 55 9229 35 02012008 1 SIII A50 2008081 02010008 0201 2008 SELS 2 004 20061 4 54 0201 2008 1 58 001 006 1 3 9 58 0201 2008 1 529999594700 20081 CO AN s DAOINO 0301 2008 Da 2000 020102008 0301 2008 UAL 0402008 04 01 QUE 7 2 0201 20061 75 03012006 1 559 SIIFFI 0S A 3 4 1 t 1 1 L 1 1 L 1 1 L DTI 2008 14 QT l4 a LL L 1 L i 1 L L 1 i 1 SSSI L9 0401 2000 1 ece O F O 25 linktblswiinter1 Table T aons opens open 27 0201 2006 08 15 02 01 2008 08 42 P 0401 2008 11 04 04 01 2008 12 34 040172008 08 50 04 01 2008 10 23 0301 2008 11 15 03 01 2008 13 10 0201 2008 09 00 02 01 2008 11 15 0201 2008 09 35 02 01 2008 10 10 0701 2008 11 05 07 01 2008 12 25 0701 2008 08 50 07 01 2008 10 00 02401 2008 10 20 02 01 2008 10 51 0201 2008 15 45 02 01 2008 17 25 0201 2008 11 20 02 01 2008 12 00 0201 2008 13 35 02 01 2008 14 50 0201 2008 08 30 02 01 2008 10 30 021 2008 08 30 02 01 2008 10 30 0201 2008 08 30 02 01 2008 10 30 0301 2008 14 40 03 01 2008 16 40 04401 2008 08 45 04401 2008 10 45 0301 2008 13 00 03 01 2008 14 55 0401 2008 13 05 04 01 2008 14 50 0201 2008 14 30 02 01 2008 16 04 03401 2008 16 45 03 01 2008 18 52 0501 2008 09 30 05 01 2008 10 35 0401 2008 08 25 04 01 2008 08 45 040
23. NTERNO 15 56806 This value is required 1227 2010 linkthlswinter1 INTERNO 16 56807 This value is required 1227 2010 linkthlswinter1 INTERNO 19 56808 This value is required 12407 2010 linktblswiinter1 OPNNIS1 15 56806 This value is required E 1207 2010 linkthlswiinter1 OPNNIS1 16 56607 This value is required o 12707 2010 linktblswiinter1 OPNNIS1 19 56808 This value is required te 12 07 2010 linkthlswiinter1 OPnnsirisk 15 56606 This value is required 12 07 2010 linkthlswiinter1 OPnnsirisk 16 56607 This value is required m 12407 2010 linkthlswiinter1 OPnnsirisk 19 56808 This value is required EE E Qry_LinkErrors Select Query TestDate TableName Fieldiame iDN RECORDNO Description _ E 1207 2010 linktblswiinter1 opdurat_n 15 56740 This value is required EX 1207 2010 linkthiswinter1 opdurat_n 16 56741 This value is required 1272019 linkthlewiinter1 nndurat n 19 SA74 This value is renuirer E Qry_LinkErrors Select Query reste Tabiename Fieli me IDN _ RECORDNO Descripton J 1207 2010 linkthlswiinter1 Swil IDO 15 56740 This value is required 1207 2010 linkthlswiinter1 Swil_1D0 16 56741 This value is required ANTONIN linkthlesniinter1 Sil IN 19 SR74 This walie is reanirend Figure 3 3f validation des donn es d intervention champs obligatoires interno opnnis1i opnnsirisk opdurat_n swil_id0 Correction des donn es interm diaires L onglet Correct Intermediate data p
24. O gt NN EN RAR RING RUN GA GT A GI RING NN NN OA OA CN Figure 3 1 4a Fichier de donn es Excel avec donn es d intervention 12 3 2 Chargement des donn es sources Il est possible de charger d examiner et ventuellement d adapter des donn es sources dans l onglet Source date puis de v rifier quels champs correspondent ou non ce tableau de destination Pour pouvoir charger les donn es sources dans NSIHwin un fichier MS Excel que l on peut s lectionner et importer dans NSIHwin via le bouton Upload gt doit tre disponible Le nom de ce fichier et le nombre de colonnes peuvent tre choisis de mani re arbitraire il est toutefois indispensable que les en t tes des colonnes pr sentes portent exactement le m me nom que dans le tableau de destination Directement apr s l importation du tableau d origine les noms des colonnes pr sentes sont valid es si un ou plusieurs champs ne sont pas reconnus une fen tre contenant le feed back ce sujet appara t il convient ensuite de cliquer sur le bouton Errors pour obtenir une liste des champs non reconnus voir l exemple figure 3 2 3 Il est possible de pr parer dans le fichier Excel source une combinaison de plusieurs tableaux et de les importer l aide de diff rentes d finitions d importation Dans chaque d finition d importation seuls les champs appartenant au tableau de destination sp cifique sont retenus lors de l importation Si n ce
25. U Exemple de surveillance SSI Le tableau tblswilnter contient des donn es relatives aux interventions chirurgicales et au suivi des patients apr s la sortie de l h pital Il est hi rarchiquement associ au tableau tblpatient qui contient des donn es relatives aux admissions des patients l h pital Pour importer des interventions chirurgicales les admissions auxquelles correspondent ces interventions devront galement tre import es Si hormis le num ro d admission aucune autre information sp cifique au patient ne doit tre import e les codes d admission peuvent tre d finis automatiquement partir de la d finition d importation pour les interventions chirurgicales voir plus loin Si des donn es sp cifiques au patient comme par ex le nom ou la date de naissance sont fournies celles ci doivent tre import es en premier lieu l aide de la d finition d importation pour ALL Patient Hospital Admissions itblpatient Relationships tblSepmo Hopname Infnr Sep_service Sep_ward ddt_ser icu24 clin_unk Fever Chills Hypoten Hypother pnea Bradycar x icumo_ref0 ab_id ab_res ADMISDTICU nl D priorcode E UNIT Origin SURG_TYPE SURG_SITE SURG_SITEZ TRAUMA IMMUNITY ANTIBIOTIC z CRE ICLUdbdamt_id0 ICUdbdamt_ref0 dbdamt_class dbdamt_ind icuamt_ref0 icuamt_day SwiMoLabn SwiMoCode SwiMoCom SWSUCHEST SwiMoSpec S WSULEG texti SWDECHEST datei
26. WETENSCHAPPELIJK INSTITUUT VOLKSGEZONDHEID INSTITUT SCIENTIFIQUE DE SANTE PUBLIQUE Logiciel NSIHwin pour la Surveillance Nationale des Infections li es aux soins Manuel d utilisation Module d importation Version 4 09 octobre 2010 Institut Scientifique de Sant Publique Direction op rationnelle Sant publique et Surveillance Surveillance Nationale des Infections li es aux soins NSIH Juliette Wytsmanstraat 14 1050 Bruxelles Belgique http www wiv isp be nsih http ww wiv isp be TABLE DES MATI RES l 2 3 3 1 3 1 1 2 12 3 2 33 3 3 1 3 3 2 3 3 3 3 4 3 5 OO E E E E E E 3 Importation des donn es NSIHwin V1 V2 V3N 4 Importation des donn es de format MS Excel x1s 5 DO ee de ee ne Se do aie 5 S lection d une ou de plusieurs d finitions d importation en fonction des donn es qui Gone E ADO E 6 Ouverture d une d finition d importation ss 9 Chargement des donn es SORA mc 13 Importation dans le tableau interm diaire 15 Importation et Validation des donn es interm diaires 15 Correction des donn es interm diaires ss 21 Description des proc dures de mise jour disponibles ssonenessssssssoeeresssssseeresssss 27 Importation dans le tableau de destination 29 Suggestions concernant cette proc dure d importation 30 Introduction NSlHwin est le logiciel de l Institut Scientifique de Sant Publique ISP relatif l enregistrement des infections nosocomi
27. adapt votre convenance Cette proc dure est toutefois d conseill e parce que les r gles de validation d un enregistrement sp cifique pourraient ainsi tre transgress es ce qui rendrait impossible l ouverture de cet enregistrement via le module NS Hwin data input analyse amp export La moiti inf rieure de la fen tre pour finir se compose de trois onglets Source data Intermediate data et Destination data qui permettent de parcourir les trois tapes d importation dans NSIHwin sections 3 2 3 4 Exemple de surveillance SSI la figure 3 1 4a montre une liste MS Excel destin e l importation dans NSIHwin avec les donn es relatives aux interventions chirurgicales Elle se compose des l ments suivants o les donn es d intervention concernent les donn es de la premi re semaine de janvier 2008 dans l h pital avec le code NSIH 9999 La liste a t obtenue par le biais d une exportation de la base de donn es administrative de l h pital 11 EJ Microsoft Excel ProcData a xls dE Fie Edit View Insert Format Tools Data Window Help Adobe PDF BRA EFEN NRA NRA A1 hopidn 9999 9999 9999 9999 9999 9999 9999 9999 9999 9999 9999 9999 9999 9999 9999 9999 9999 9999 9999 9999 9999 9999 9999 9999 9999 9999 l objectif de cette liste est d importer toutes les donn es de surveillance relatives aux interventions concern es et aux variables de risques correspondantes pour ens
28. ai IDN 441n735 4 4410735 must he nresent in thlPatient IDA zl Record 14 4 10 i r of 40 Figure 3 3 a 6 Liste linkerrors avec erreurs de validation s lectionn es pour le champ cl principal icu_id0 o Les erreurs de validation restante figure 3 3 10 concernent les champs hopidn idn et unito Il ressort de ces avis que le code d h pital 9999 les num ros d admission des patients 18 et le code de l unit de soins intensifs ICU 1 qui doivent tre import s n apparaissent pas encore dans les tableaux de r f rence tblhospital tblpatient et thblhopunit Il existe ici aussi des proc dures de mise jour pour r soudre ce probl me automatiquement voir le point 3 8 b pour des explications et un exemple Exemple de surveillance SSI suite Dans la figure 3 2 via l cran Import Definition une liste Excel comprenant les donn es d intervention tait import e pour le tableau tbiswiinter Ces donn es sont ensuite trait es de la fa on suivante dans le m me cran o Observons une fois encore le tableau d origine import de la figure 3 2 5b Un examen plus approfondi figure 3 3a permet de constater deux doubles observations dans ce tableau savoir pour les op rations de Hernies sur les patients avec le code d admission champ idn 24 et 99 Avant de proc der l importation finale ces op rations doivent tre d doubl
29. ales dans les h pitaux belges Les donn es collect es par le biais des protocoles de surveillance suivants peuvent tre introduites Septic mies nosocomiales hospital wide NSIH SEP Infections nosocomiales aux soins intensifs NSIH ICU Infections du site op ratoire NSIH SSI Hygi ne des mains NSIH HH Le module Data Import se trouve dans une application s par e NSIHWIN_1 40 mdb Veuillez consulter le manuel NSIHwin Data Entry amp Analysis pour les informations au sujet de l installation et de la configuration de ce logiciel Le menu principal de la Figure 1 1 appara t lorsque vous lancez le module d importation des donn es E Nsihwyin National Surveillance of Hospital Infections M Data import V1 V2 4V3 M About Data import MS Excel xls o Update o Lookup lists and table definitions o Quit BR Figure 1 1 Menu principal pour l importation des donn es NSIHwin Les principales nouveaut s dans le module d importation V4 09 sont La possibilit de d doubler automatiquement les donn es d importation La possibilit d adapter automatiquement les donn es importer afin de les rendre conformes aux r gles de validation Les actions suivantes peuvent entre autres tre r alis es l aide de proc dures pr d finies o le d doublement automatique des donn es d importation o la cr ation automatique des champs cl s obligatoires o la nouvelle codificatio
30. chirurgie classe de l sion score asa et endoscopie s ils varient sur diff rents codes ICD 9 CM pour le m me patient Les champs dur e de l op ration et indice de risque NHSN doivent tre recalcul s apr s transformation voir plus loin option 1 NHSN code M me proc dure que la pr c dente mais appliqu e la cat gorie horizontalize d op ration NHSN la place du code ICD 9 CM option 1 where empty sets D termine les champs avec les cat gories d op ration NHSN opnnis1 2 3 based on opnnis1 opnnis2 et opnnis3 sur la base des champs avec le code opcode1 2 3 ICD 9 CM opcode1 opcode2 et opcode3 where empty sets duration of D termine la dur e de l op ration en minutes dans le champ surgery based on start and opdurat_n sur la base du d but et de la fin de la chirurgie dans les end time of surgery champs opbegins et opends where empty sets NHSN risk Calcule l indice de risque NHSN sur la base des champs cat gorie index d op ration dur e de l op ration classe de l sion score asa et endoscopie 3 4 Importation dans le tableau de destination Dans le troisi me et dernier onglet destination data figure 3 4 1 les donn es du tableau interm diaire sans erreurs de validation sont import es dans le tableau de destination Le champ records without errors indique le nombre de lignes dans le tableau interm diaire pour
31. de sortie sont respectivement admisdticu et icu_dis_sta Pour corriger cela il convient de revenir au fichier source MS Excel de l ouvrir nouveau dans MS Excel de corriger les noms de champs et de sauvegarder de nouveau le fichier Il faut ensuite revenir la d finition d importation NSIHwin pour le tableau de destination tblicu_data et importer nouveau ICU_Admissions xls bouton Upload La confirmation 0 unmatched field names found appara t alors et indique que tous les champs du fichier source correspondent au tableau de destination En cliquant sur Open nous pouvons ouvrir le tableau d origine et v rifier si les 10 s jours de patients ont t r ellement import s dans xls_tblicu_data Figure 3 2 4 ioii Lt Lan mien ieu ts sta enpe tot origan 19 01 2004 alive 23 other 1 1201 2004 20 01 2004 died other 1 23 01 2004 2701 2004 alive community 1 04 01 2004 05 01 2004 alive other 1 29 01 2004 other 1 10 01 2004 16 01 2004 alive other 1 02 01 2004 04 01 2004 alive other 1 19 01 2004 2401 2004 alive other Record 14 4 ci 2 r of 10 Figure 3 2 4 fichier source import xls_tblicu_data Exemple de surveillance SSI suite l importation du fichier Excel avec les interventions de la figure 3 1 4a via l onglet Source data se d roule comme suit o Comme mentionn ci dessus le fichier contient des donn es relatives aux interventions 14
32. der les donn es destin es l importation Pendant cette validation les donn es d importation sont soumises une s rie de tests servant notamment v rifier si les champs obligatoires sont bien pr sents si les champs ont t correctement encod s si les informations dans les champs cl s sont pr sentes et uniques ou encore si le format des champs remplis est correct etc Si n cessaire les donn es du tableau interm diaire peuvent tre corrig es afin de r duire les erreurs de validation Dans la derni re tape section 3 4 de la proc dure d importation les lignes records du tableau interm diaire ne contenant pas d erreurs de validation sont import es dans le tableau de destination Ces tableaux de destination sont galement utilis s par le module data entry analysis amp export de NSIHwin 3 1 1 MS Excel Source data file NSIHwin Import module Source table Intermediate table 3 Target table Figure 3 1 1 Sch ma Organigramme de la proc dure d importation S lection d une ou de plusieurs d finitions d importation en fonction des donn es qui doivent tre import es La liste des d finitions d importation disponibles s affiche dans la fen tre NSIHwin Import Definition List Figure 3 1 2 Chaque d finition est toujours associ e un tableau de destination NSIHWIN sp cifique colonne Table gt dans lequel doivent se retrouver les donn es d importation externes Les
33. diaire contenait encore des enregistrements d un fichier source pr c dent Cliquer sur le bouton Open permettra d ouvrir le tableau interm diaire pour le contr le visuel ou l adaptation manuelle des donn es importer 15 NSlHwin Import Definitions 1 IMPORT DEFINITION Definition Protocol Destination table Table Field tblhospital v Fields Categories Open Source data Intermediate data Correct intermediate data Destination data 3 IMPORT INTERMEDIATE TABLE remove double delete obs obs before before i Import Query Intermediate Table import import ary_xls_thlhospital_linkthihospitali w linktblhospitali M M Import Open 4 TEST INTERMEDIATE TABLE Records Lasttested Errors ju ES Test Errors Figure 3 8 1 Onglet ntermediate data Exemple de surveillance ICU suite Le tableau d origine xls tblicu_ data contient les donn es de 10 s jours de patients aux soins intensifs Il s est av r apr s avoir r alis un contr le que tous les noms de champs correspondent au tableau de destination voir plus haut En cliquant sur le bouton Import les donn es sont pr sent d plac es du tableau d origine vers le tableau interm diaire La confirmation 10 records import in linktblicu_ data appara t En cliquant sur le bouton Open le tableau linktblicu datat s affiche Figure 3 3 2 Il convient de noter que ce tableau contient beaucoup plus
34. dmissions ICU se trouvant dans le tableau tblicu data et il est impossible d encoder des infections inconnues c d dans donn es d admission Avant de pouvoir importer les infections dans le tableau tblICU_ bacs les donn es d admission de ces patients devront donc d abord tre pr sentes dans le tableau tblilCU data On remarque galement que le tableau tbliCU data est reli au tableau thlpatient ce qui signifie que seules les admissions ICU pour lesquelles une admission l h pital a t import e dans tblpatient peuvent tre import es Les donn es ICU seront donc import es dans l ordre suivant tblpatient gt tblicu data gt tblicu bacs Toutefois la participation la surveillance ax e sur l unit des Infections contract es aux Soins intensifs level 1 englobe la collecte des donn es relatives aux infections et un d nominateur pour la p riode de participation sans collecte s par e des donn es patients pour une admission l h pital et dans l unit de soins intensifs L importation des donn es relatives aux infections dans le tableau tbliCU_ bacs ne doit donc pas tre pr c d e par une importation s par e des admissions des patients et ICU respectivement dans les tableaux thlpatient et tblICU data une proc dure automatique qui compl te automatiquement les deux tableaux ci dessus est disponible dans la d finition d importation pour les infections IC
35. ds Categories Open e Source data Intermediate data Correct intermediate data Destination data 3 IMPORT INTERMEDIATE TABLE remove double delete obs obs before before Import Query Intermediate Table import import inktblswintert M Mv Import Open 4 TEST INTERMEDIATE TABLE Records Lasttested Errors Figure 3 3b importation des donn es d intervention dans le tableau interm diaire Errors 19 linktblswiinter1 Table 02401 2008 04017 2008 04017 2008 03401 2008 02401 2008 02401 2008 07401 2008 07401 2008 02401 2008 02401 2008 02401 2008 02401 2008 02401 2008 02401 2008 02401 2008 03401 2008 04017 2008 03401 2008 0401 2008 02401 2008 03401 2008 05401 2008 02401 2008 08 15 04401 2008 11 04 04 01 2006 08 50 03401 2008 11 15 02401 2008 09 00 02401 2008 09 35 07401 2008 11 05 07 01 2006 08 50 02401 2008 10 20 02401 2008 15 45 02401 2008 11 20 02401 2008 13 35 02401 2008 08 30 02401 2008 08 30 02401 2008 08 30 03401 2008 14 40 04401 2008 08 45 03401 2008 13 00 04401 2008 13 05 02401 2008 14 30 03401 2008 16 45 05 01 2008 09 30 02401 2008 08 42 04 01 2008 12 34 04 01 2008 10 23 03 01 2006 13 10 02 01 2008 11 15 02 01 2006 10 10 07 01 2008 12 25 07 01 2006 10 00 02 01 2008 10 51 02 01 2008 17 25 02 01 2006 12 00 02 01 2006 14 50 02 01 2008 10 30 02 01 2008 10 30 02 01 2006 10 30 03 01 2006 16 40 04 01 2006 10 45 03 01 2006 14 55 04 01 2008 14 50 02 01 2006 16 04 0
36. ermet d adapter automatiquement les donn es pr sentes dans le tableau interm diaire l aide d une s rie de proc dures d finies Le but est de faire gagner du temps l utilisateur lors de la pr paration des donn es destin es l importation Certaines de ces proc dures sont sp cifiques pour les donn es importer d autres se retrouvent dans chaque tableau La section 3 3 c fournit une description des proc dures disponibles Quelques exemples le nouvel encodage automatique des cat gories sp cifiques l utilisateur en fonction des valeurs par d faut sur la base d un tableau de conversion dans chaque tableau l assemblage automatique des champs cl s obligatoires _id0 et _ref0 sur la base des champs individuels du tableau interm diaire sur lequel sont bas s ces champs cl s dans chaque tableau la suppression automatique des observations avec des champs obligatoires vides pour l importation de septic mies nosocomiales de s jours aux soins intensifs ou d interventions chirurgicales et si aucun facteur de risque au niveau du patient comme l ge ou le sexe n a t import la cr ation automatique d observations sur l hospitalisation dans le tableau thlpatient pour l importation de donn es pour la surveillance level 1 aux soins intensifs collecte de donn es ax es sur l unit la cr ation automatique d observations sur l admissions aux soins intensifs dans le tableau tblICU_ data
37. ermin e sur la base du code ICD 9 CM dans opcodei opdurat_n dur e de l op ration doit tre d termin e sur la base de opbegins et opends gt PAS lt opnnsirisk l indice de risque NHSN doit tre calcul sur la base des champs opnnisi opdurat_n opcontamcl opasa et opendo n les noms des champs premi re ligne de la liste Excel suivent scrupuleusement les sp cifications du rapport table fields Les cat gories de champ suivent le rapport Field Categories de la d finition d importation susmentionn e il tait impossible de d terminer automatiquement le code NHSN ou de calculer l indice de risque NHSN Ces variables doivent tre d finies automatiquement pendant l importation en vue d utiliser les rapports NSIHwin qui r sument les incidences SSI par cat gorie d op ration NHSN chirurgien et indice de risque NHSN la liste peut contenir des lignes doubles Dans ce cas ces observations doivent tre supprim es automatiquement pendant la proc dure d importation MISES XX Lo Ar Type a question For help EEEF e v hopidn idn _interDt ophegins opends opcodel opcontamci opendo_n opelec_n 58 58 58 15 24 24 35 52 21 54 72 45 59 75 20 66 65 95 99 99 19 16 67 90 31 30 02 01 2005 02 01 2008 02 01 2008 02 01 2008 02 01 2008 02 01 2008 02 01 2008 02 01 2008 02 01 2008 02 01 2008 02 01 2008 02
38. es interventions chirurgicales NSIHwin se base sur une structure de base de donn es relationnelle dans laquelle la plupart des tableaux sont associ s d autres tableaux situ s un niveau sup rieur et ou inf rieur dans la hi rarchie cela afin d viter une importation multiple des donn es Il convient d en tenir compte pendant l importation un tableau situ un niveau inf rieur dans la hi rarchie ne pourra tre import que si les donn es sont pr sentes dans des tableaux associ s d un niveau sup rieur Le rapport NSIHwin Table Relations figure 3 1 3 qui est accessible en cliquant sur le bouton Relations contient des informations suppl mentaires sur les relations entre les tableaux Remarque importante Le parcours hi rarchique des tableaux lors de l importation des donn es n est n cessaire que si pour chaque tableau des informations pertinentes doivent galement tre import es pour son niveau Si ce n est pas le cas des proc dures permettant de compl ter automatiquement les observations manquantes un niveau hi rarchique sup rieur sont disponibles dans chaque d finition d importation Exemple surveillance ICU le tableau tblICU bacs contenant les donn es d infection pour la surveillance ICU est reli au tableau tblICU data qui contient les donn es d admission ICU Soins intensifs De cette mani re chaque infection encod e dans tblicu Bacs est bas e sur l une des a
39. ggestions concernant NSIHwin vous pouvez nous contacter l adresse reprise ci dessous Institut Scientifique de Sant Publique DO Sant publique et Surveillance NSIH Rue Juliette Wytsman n 14 B 1050 Bruxelles T l 02 642 57 95 Fax 02 642 54 10 E mail nsih wiv isp be Site Internet http www nsih be Importation des donn es NSIHwin V1 V2 V3 Import HSIHwin Y2 import AE Figure 2 1 Les nouvelles versions de NSIHwin apparaissent toujours avec un fichier de donn es vide Il est donc n cessaire d importer les donn es partir de versions plus anciennes Apr s avoir cliqu sur NSIHwin 1 Import ou NSIHwin 2 import le message de la Figure 2 2 s affiche Celui ci vous demande si vous avez d j sauvegard le fichier de donn es Nsihwin_t_40 mdb dans le r pertoire data Si vous n avez pas encore fait de copie du fichier Nsihwin_t_40 mdb cliquez sur No La proc dure d importation s arr te et vous pouvez faire une copie de r serve de ce fichier Si vous cliquez sur Yes la proc dure d importation se poursuit NSIHwin Import This procedure is irreversible so you better backup your NSIHWin_t_30 mdb file Are you sure you want to continue Figure 2 2 Dans la fen tre de la Figure 2 3 s lectionnez le fichier de donn es de la version pr c dente de NSIHwin partir de laquelle vous voulez importer les donn es Les emplaceme
40. horizontal peut tre r alis e via la proc dure de mise jour avec la description optiont ICD9 CM code horizontalize Apr s avoir s lectionn et ex cut cette proc dure nous obtenons les donn es dans le tableau interm diaire de la figure 3 3 b 11 les trois observations du patient 58 sont ici r duites une observation o La proc dure ci dessus ne transforme pas exclusivement les donn es dans le champ opcode1 pour les codes ICD 9 CM sur un m me patient et une m me date qui apparaissent sur plusieurs lignes elle minimise les valeurs de champ dans le champ opbegins et maximise celles des champs opends opcontamci opasa et opendo_ n Apr s l ex cution de cette proc dure les champs opdurat_n et opnnsirisk doivent par cons quent tre recalcul s via des proc dures de mise jour d j mentionn es Une fois ex cut es aucune erreur de validation n est plus observ e Tesse Tabename Fidiame RECORDNO O 13 07 2010 links winter Si IDO 56 56564 551 9999 56 02401 2006 1 must be a unique value in this table OPENDS A 02401 2008 81 53 02401 2008 13 35 02401 2008 14 50 0240172008 COLO 02401 2008 08 30 02 01 2008 10 30 02401 2008 COLO 02 01 2006 08 30 02401 2008 10 30 1 1 1 1 020172008 COLO 02 01 2008 08 30 02 01 2008 10 30 B 1 1 4 551 9999 54 02 01 2008 1 58 02 01 2008 1 01 2008 1 S 58 0201 72008 1 9999 551 9999 59 03 01 72008 1 59 03401 2008 45 76 COLO 0
41. ien dans le champ opsurgi du tableau interm diaire n ont pas encore t enregistr s dans le champ surgeon init du tableau de r f rence associ tilkpswisurg Cet enregistrement peut tre ex cut automatiquement en s lectionnant la deuxi me proc dure de mise jour avec la description appends missing opsurg1 to table tlkoswisurg gt o Apr s avoir s lectionn les trois premi res lignes dans la liste avec les proc dures de mise jour et avoir cliqu sur Run selected l heure et la date d ex cution sont affich es dans chacune de ces lignes Il convient ensuite de cliquer sur le bouton Test dans l onglet Intermediate data et l avis 120 errors appara t indiquant que les erreurs de validation mentionn es plus haut ont bel et bien t supprim es de la liste 24 gt Correction Ho Query Description Last Run Run sel ory linkthl s appends missing h_code to table thlhospital 1lar _linkt ls se appends missing idn codes to thipatient Z es a ES S E E e E S S RE ES BE RE BR BR EE EE 19 05 2010 4 56 25 MH gry _linkthls se loption 2 NHSN code horizontalize EE o S0lry linktbls loption 1 fills MHSWT 23 based on ICD9 CM1 2 3 where empty 11 07 2010 16 01 04 o 111 Gry inkthis s ltil in duration based on begins enda where empty 1905 2010 120lary_linktbls se fil risk index where empty 1905 2010 200lar _linkthls s deletes lines where ho
42. ion se compose d un en t te et de 4 onglets L en t te contient les donn es de base permettant d identifier la d finition d importation comme la d finition lt definition le code du protocole de surveillance pour lequel les donn es sont enregistr es protocol gt et le nom du tableau de destination destination table dans lequel les donn es finales sont import es l aide des boutons Table Fields et Field Categories il est possible d ouvrir deux rapports fournissant des informations d taill es sur le tableau de destination et sa structure Les informations contenues dans ces rapports sont indispensables lors de la pr paration des donn es pour l importation dans MS Excel tout cart de ces donn es d importation par rapport aux sp cifications de ces deux rapports causera en effet des erreurs de validation sur les donn es importer et NSIHwin permet uniquement l importation des observations sans erreurs de validation Le rapport Table Fields Figure 3 1 5 indique pour le tableau de destination la liste de tous les champs et par champ diff rentes informations comme le nom Field gt si le champ est un champ cl unique Primary gt ou si le champ est obligatoire Required gt le format de donn es Datatype la taille Size s il s agit d un champ cat gorie Category et la description de l information qui est conserv e dans ce champ Descri
43. lesquels aucune erreur de validation n a t constat e au cours de la proc dure de test seules celles ci seront import es dans le tableau de destination Si ce nombre est donc beaucoup moins lev que le nombre total de lignes dans le tableau interm diaire champ records dans l onglet intermediate data cela signifie que les donn es interm diaires n cessitent encore quelques adaptations pour pouvoir tre import es L option update existing records doit tre coch e si des observations existantes doivent tre adapt es plut t qu import es Si l option est coch e cette adaptation est ex cut e cons cutivement l importation de 29 3 5 nouvelles observations Avec le bouton import l importation finale est effectu e apr s quoi le nombre d observations import es ou adapt es appara t avec la date d importation dans les champs records without errors et Last Import Le tableau de destination peut tre ouvert et l importation peut tre contr l e via le bouton Open dans l en t te de la fen tre Import definition 6 IMPORT IN DESTINATION TABLE Records Update without existing errors Last Import Link Query Hame records 22 qry_linktblswiinter1 _tbhlswiinter is Import Figure 3 4 1 Importation du tableau interm diaire valid dans le tableau de destination Exemple de surveillance ICU suite Dans la d finition d importation pour les donn es d admissi
44. n automatique des champs cat gorie o la cr ation automatique de valeurs de r f rence obligatoires dans les tableaux associ s par exemple pour l importation de Septic mies pour la surveillances Septic mies nosocomiales hospital wide la cr ation automatique du code d admission du patient dans le tableau tolpatient et le ward code dans le tableau tlkpward o la d termination automatique des champs calcul s comme par ex dur e de l op ration ou indice de risque NHSN pour l importation des donn es d intervention pour la surveillance des Infections du site op ratoire o la d termination automatique du code inconnu pour les champs obligatoires o Pour l importation des donn es de culture microbiologique l ajout automatique des marqueurs obligatoires pour la r sistance aux antibiotiques avec le r sultat inconnu o la cr ation automatique de donn es du d nominateur pour l h pital ou l unit de soins intensifs sur la base de donn es individuelles concernant les admissions et les sorties 2 Mis part la possibilit d j existante d importer des donn es il est pr sent possible d adapter des donn es existantes via le module d importation et cela pour tous les tableaux qui peuvent tre import s Une description pas pas de l importation lectronique des donn es d intervention pour la surveillance SSI dans ce manuel En cas de probl mes ou de su
45. nominators thildeno_hos pour chaque p riode le code h pital la date de d but et de fin doivent tre compl t s dans des lignes diff rentes et manuellement Plusieurs p riodes par exemple les 3 mois d une p riode de participation sont donc autoris es La proc dure automatique compl te ensuite automatiquement les d nominateurs manquants pour chaque p riode en agr geant les donn es d admission transforms ICU admission Sur la base des donn es d admission aux soins intensifs ICU et d une data to ICU denominator for p riode sp cifique cette proc dure calcule automatiquement les SEP surveillance donn es du d nominateur pour l unit de soins intensifs ICU unit Les donn es d admission doivent tre import es dans le tableau interm diaire via la d finition d importation pour ICU Admissions tblICU_ data L importation finale avec la validation correspondante n est donc pas n cessaire Seuls les champs code h pital code unit date d admission et date de sortie pour chaque patient doivent tre fournis La p riode pour laquelle le d nominateur doit tre calcul doit ensuite tre indiqu e dans le tableau interm diaire de la d finition d importation Denominators tbldeno_hos pour chaque p riode le code h pital la date de d but et de fin doivent tre compl t s dans des lignes diff rentes et manuellement Plusieurs p riodes par exemple les 3 mois d une p riode de participati
46. nt Exemple de surveillance ICU suite Nous testons les donn es dans le tableau interm diaire en cliquant sur le bouton Test L avancement de la proc dure de test appara t dans la zone de feed back inf rieure de l onglet A la fin est affich e la confirmation Intermediate date table f linktblicu_ data tested 60 errors found suivie de la liste des erreurs de validation figure 3 3 3 O La premi re ligne de la liste Linkerrors Figure 3 3 a 3 en haut concerne une erreur de validation concernant le format du champ Admisdticu Le num ro d enregistrement 52 avec IDN A40735 pr sente en effet une date dans laquelle le mois OP n est pas reconnu La derni re ligne de Linkerrors Figure 3 3 a 3 en bas mentionne galement une erreur de validation sur le champ saps_tot de sorte que la valeur 2Z dans la ligne 53 avec IDN A37568 n est pas reconnue comme num rique Pour corriger ces erreurs de validation clairement caus es par des fautes de frappe il suffit d ouvrir le tableau interm diaire et de corriger manuellement les valeurs 16 0P 2004 en 16 01 2004 et 2Z en 27 dans ces observations respectivement les champs admisdticu et saps_tot Une fois la correction effectu e le tableau interm diaire et la liste linkerrors doivent tre ferm s et la proc dure de test est nouveau ex cut e avec 58 errors comme r sultat
47. nt doit galement tre utilis e pour ces variables C est probablement possible partir d un tableau Excel dans lequel les champs intervention et patient apparaissent conjointement Supprime les observations dans lesquelles la les valeur s d au moins un champ obligatoire fait font d faut D termine l observation obligatoire avec la culture ou le microorganisme dans le tableau de r f rence Tbl mo si elle n existe pas encore Les marqueurs sont compl t s automatiquement pour la r sistance antimicrobienne obligatoire s ils n apparaissent pas Le r sultat pour ces marqueurs est d sign comme inconnu Assemble le champ obligatoire avec le code de priorit pour le marqueur AMR s il n est pas compl t Description Sur la base des donn es d admissions aux soins intensifs ICU admissions level 2 into unit import es et d une p riode sp cifique cette proc dure calcule 21 denominator level 1 automatiquement les donn es du d nominateur Les donn es d admission doivent tre import es dans le tableau interm diaire via la d finition d importation pour ICU Admissions tblICU_ data L importation finale avec la validation correspondante n est donc pas n cessaire Seuls les champs code h pital code unit date d admission et date de sortie pour chaque patient doivent tre fournis La p riode pour laquelle le d nominateur doit tre calcul doit ensuite tre indiqu e dan
48. nts et noms des diff rentes versions sont indiqu s ci dessous NSIHwin v1 NSIHwin data NSIHwin_tbl mdb NSIHwin V2 0 NSIHwin data NSIHwin_2001 mdb NSIHwin V2 1 NSIHwin v21 data NSIHwin_t 21 mdb NSIHwin V3 NSIHwin v30 data NSIHwin_t_30 mdb Apr s la s lection de ce fichier la proc dure d importation se poursuivra automatiquement Look in a Data z amp l ci 2 nsihwin_tblmdb File name Open Files of type Microsoft Access mdb Cancel M Open as read only Figure 2 3 Importation des donn es de format MS Excel xis Aper u Les donn es qui sont encod es dans NSIHwin sont sauvegard es dans une s rie de 15 tableaux Pour chacun de ces tableaux il est possible d importer les donn es partir d un fichier MS Excel xis en suivant les tapes mentionn es ci dessous figure 3 1 1 Durant la premi re tape section 3 2 le fichier d importation externe le fichier source est import dans NSIHwin dans le tableau d origine Ce tableau sert avant tout valider les noms des champs ces derniers doivent en effet correspondre au tableau NSIHwin dans lequel se retrouveront les donn es il s agit du tableau de destination La deuxi me tape section 3 3 comprend l importation des donn es du tableau d origine vers le tableau interm diaire Ce tableau a une structure identique celle du tableau de destination correspondant et sert sp cifiquement vali
49. nvient donc d abord d examiner quelles informations s appliquent les donn es et d essayer de les associer un tableau de destination sp cifique Les informations pr sentes dans les colonnes protocole et info peuvent cet effet s av rer utiles Les d finitions d importation d un protocole de surveillance sp cifique peuvent tre filtr es l aide du menu protocole Exemple surveillance ICU Pour importer les donn es d admission ICU il convient de choisir la d finition d importation level 2 1 ICU admission data gt Les donn es d infection ICU peuvent tre import es via la d finition d importation level 1 2 ICU infection data La d signation level indique quelle option d admission de surveillance ICU appartiennent les donn es concern es Level 1 2 signifie par exemple que ce tableau doit tre import si vous participez au level 1 surveillance ax e sur l unit ou au level 2 surveillance ax e sur le patient Exemple de surveillance SSI Apr s avoir indiqu SSI dans le menu protocole seules les d finitions d importation pertinentes pour la surveillance des Infections du site op ratoire sont affich es La ligne ALL Hospital admission data thlpatient restitue la d finition d importation pour importer les donn es d hospitalisation la ligne SSI Intervention data tblswiinter restitue la d finition d importation pour importer les donn es d
50. on aux soins intensifs ICU dans le tableau de destination tblicu data le test sur les donn es interm diaires dans l onglet intermediate data gt a donn comme r sultat final 0 errors Dans l onglet Destination data Figure 3 4 2 il convient de cliquer sur le bouton Import Le r sultat est 10 lines records without errors imported in tblicu data Dans la ligne de la d finition d importation du tableau tblicu_ data la date d importation et les 10 lignes qui viennent d tre import es Source data Intermediate data Destination data 6 IMPORT IN DESTINATION TABLE Records without errors Last Import 10 07 04 2004 Link Query Hame ar _linkthlicu_datai_thlicu_data x Figure 3 4 2 importation de linktblicu_datai dans tblicu_ data Exemple de surveillance SSI suite Quand dans intermediate data gt on ne retrouve plus aucune erreur dans le tableau interm diaire avec les donn es d intervention l onglet destination data indique le nombre de lignes sans erreurs 22 En cliquant sur Import on obtient la confirmation de la figure 3 4 3 22 records imported Il est ensuite possible d ouvrir le NSIHwin data entry analysis amp export et de v rifier si ces interventions ont effectivement t import es de les compl ter et de les analyser Microsoft Office Access 22 lines records without errors imported in tblswinter
51. on sont donc autoris es La proc dure automatique compl te ensuite automatiquement les d nominateurs ICU manquants pour chaque p riode en agr geant les donn es d admission aux soins intensifs Surveillance NSIH SSI Importation de donn es d intervention et de suivi via la d finition SSI Interventions and patient follow up tblswiinter Proc dure de mise jour Description where missing appends D finit les codes chirurgien dans les champs opsurg1 opsurg2 et surgeon codes 1 2 3 to table opsurg3 dans le tableau de r f rence tlkpswisurgl s ils n existent pas tkoswisurg encore where empty sets interno to R glez le num ro d intervention sur 1 s il n a pas t compl t 1 Remarque voir le protocole pour la d finition de ce champ option 1 ICD9 CM code Transforme les observations ICD 9 CM sp cifiques avec un code ICD horizontalize 9 CM par observation et uniquement dans le champ opcodei comme idn interdt opcodel A 1 1 2010 00 01 A 1 1 2010 00 02 A 1 1 2010 00 03 en observations sp cifiques l intervention comme exig selon la d finition d importation avec une intervention par observation et les codes ICD 9 CM dans les champs opcode1 opcode2 opcode3 idn interdt opcodel opcode2 opcode3 A 1 1 2010 00 01 00 02 00 03 Remarque La transformation ci dessus retient la valeur minimum du champ d but chirurgie et la valeur maximum des champs fin
52. opcontamci opendo_n opelec n opasa E 1 Record KIKI 5 e of 26 Figure 3 2 5b donn es d intervention Excel import es dans le tableau comprenant les donn es sources Importation dans le tableau interm diaire Importation et Validation des donn es interm diaires A l aide de cet onglet les donn es du tableau d origine sont import es dans le tableau interm diaire Celui ci est une copie exacte du tableau de destination final et a comme unique fonction de contr ler les donn es d importation selon une s rie des r gles de validation sp cifiques ce tableau Dans l onglet correct Intermediate data les donn es dans le tableau interm diaire peuvent si n cessaire tre corrig e via un ensemble de proc dures automatiques voir plus loin 3 3 b En cliquant sur le bouton Import figure 3 3 1 les donn es du tableau d origine sont renvoy es vers le tableau interm diaire En cliquant au pr alable sur l option remove double obs before import les donn es pour l importation sont d doubl es automatiquement De m me en cliquant sur delete obs before import le tableau interm diaire est vid avant d tre import Dans le cas contraire de nouvelles donn es sont compl t es pour les observations interm diaires d j pr sentes Cliquer sur Import permet d obtenir la confirmation du nombre d enregistrements import s dans le tableau interm diaire et de savoir si le tableau interm
53. pertoire c nsihwin v40 import est charg dans NSIHwin l aide du bouton Upload et est conserv dans le tableau de destination xls _tblicu data Figure 3 2 2 Apr s le contr le la confirmation table xIs_tblicu data tested 2 unmatched fields found click Errors appara t Apr s avoir cliqu sur le bouton Errors il appara t que les champs admdate et dissta ne sont pas repris comme nom de champ dans le tableau de destination tblicu_ data et sans correction il ne sera pas possible de les importer Figure 3 2 3 Source data Intermediate data Destination data 2 SOURCE DATA Source File Upload F nsihwin 40importiCU_admissions xls Source Table kis tolicu_data Open Tabie xis_tblicu_data tested 2 unmatched fields found Figure 3 2 2 Onglet Source data a Qry_TableErrors Select Query 0 x _ TestDate Tablellame Fieldilame 06 04 2004 xls_thlicu_data admdate No field of thlicu_data table this will NOT be imported 06 04 2004 xls_thlicu_data dissta No field of thlicu_data table this will NOT be imported Record 14 1 rija of 2 Figure 3 2 3 Liste des champs inconnus dans le fichier source ICU_Admissions Exemple de surveillance ICU suite Apr s le contr le du rapport Table Specifications figure 3 1 5 bouton Table Specs il appara t que les noms de champs corrects pour la date d admission et l tat
54. ption Le rapport Field Categories Figure 3 1 6 indique les informations n cessaires pour encoder correctement les champs cat gorie dans ce tableau Un champ cat gorie n acceptera que les cat gories Colonne Category d finies dans ce rapport D autres valeurs de cat gorie donneront une erreur de validation pendant le contr le du tableau interm diaire voir la section 3 3 rpt_tabledefinitions Report NSIHwin Import module Table Specification 05 04 2004 Table tblicu_data ICU Admission data Fidd Prim Reqg Datatype Ze Description ICU_ID0 M dhText hopidn dn admisdticu IDN dhText hospital admission 1D must refer to O tblpatient BED_NR O dbText Icu Bed no O ADMISDTICU dbDate Date of admission to ICU UNIT O dbText ICU ID Page H 1 AL a Figure 3 1 5 Rapport Table Fields pour le tableau tblicu_data i Rpt_TableCategories Report NSIHwin Import module Table Specification 05 04 2004 Table tblicu_data ICU Admission data Fidd Icu_DIS_STA Description Discharge stus Cat Description alive died at icu DNF do not reanimate alive tend of follow up Unknown Page ajaj 4 drj Figure 3 1 6 Rapport Field Categories pour le tableau Tblicu_Data Le tableau de destination est ouvert l aide du bouton Open dans l en t te de la fen tre NS Hwin import definition Le tableau qui appara t ensuite peut tre
55. r 478410 29 01 72004 other 486398 10 01 2004 16 01 2004 other 494763 02 01 2004 4 01 2004 other 497021 19 01 2004 24101 2004 other linktblicu data Table antib_nn coronary_n SURG SITE SURG_SITE2 GLASGOW GLASGOW M RegSoft SurvSubType D 1 D BR UOUN ra 10 AutoNumber 000000000000 Record TIKI 3 TECIE of 10 Figure 3 3 2 Donn es interm diaires dans le tableau linktblicu_data1 premi re partie des champs en haut et derni re partie des champs en bas Une fois que les donn es d importation ont t import es dans le tableau interm diaire celles ci doivent 16 tre valid es via le bouton Test Apr s la proc dure de test une confirmation du nombre d erreurs de validation trouv es appara t apr s quoi la liste linkerrors est affich e de fa on d taill e Il a lieu de discerner les colonnes suivantes Jestdate la date de ce test Tablename le nom du tableau interm diaire Fieldname le nom du champ dans lequel une erreur de validation a t retrouv e IDN le num ro d admission du patient auquel s applique cette observation eecordno le num ro de la ligne dans le tableau interm diaire dans lequel une erreur de validation appara t et dans la colonne Description la description de l erreur de validation Dans Description les types d erreurs de validation suivants peuvent appara tre ceux ci correspondent toujou
56. rs une condition mentionn e dans le rapport Table Fields du tableau de destination importer voir titre d illustration l exemple ci dessous This value must be unique Bien que ce champ est un champ cl unique Primary dans Table Fields gt la valeur d sign e appara t dans plusieurs lignes la valeur must be present in table nom du tableau nom du champ ce champ est li au champ indiqu nom du champ dans le tableau d sign nom du tableau et doit contenir une de ces valeurs Cette erreur se produit quand on essaie d importer un tableau dont les donn es associ es provenant d un tableau situ un niveau hi rarchique plus lev n ont pas encore t import es voir section 3 1 On peut corriger cette erreur en important d abord les donn es dans le tableau associ No regular Format de donn es format le format ne correspond pas aux exigences pour ce champ Pour y rem dier le format de donn es pour ce champ doit tre v rifi dans le rapport Table Specifications valeur is not a valid category for this field ce champ est un champ cat gorie et la valeur ne correspond pas l une des cat gories admises Dans le rapport Category specifications il convient d examiner quelles sont les cat gories possibles et de les corriger dans le tableau interm diaire This value is required ce champ doit tre rempli ce qui n est pas le cas actuelleme
57. rtoire c insihwin v40 import a comme nom ICU_ admissions xls et doit tre import dans NSIHwin L exemple pr c dent nous r v le que les donn es d admission ICU sont stock es dans le tableau de destination NSIHwin tblicu data Dans la fen tre Importdefinition list il convient de s lectionner la d finition d importation pour ce tableau de destination figure 3 1 2 et de cliquer sur le bouton Open L cran de d finition d importation pour le tableau de destination tblicu_ data s ouvre figure 3 1 4 EJ Microsoft Excel ICU admissions xls AE File Edit View Insert Format Tools Data Window Help Adobe PDF Type a question for help M MIA 6 8 ET aAA E 8 x gt 21 EE EAO hopidn IDN admdate icu_dis_dt dissta saps tot origin_n A64763 04 01 2004 5 01 2004 alive 34 other 40735 16 0P 2004 19 01 2004 alive 2 other A375686 25 01 2004 2Z community A686398 10 01 2004 16 01 2004 alive 45 other A156866 16 01 2004 17 01 2004 died 67 community 94763 02 01 2004 4 01 2004 alive 56 other A468769 12 01 2004 20 01 2004 died 43 other 97021 19 01 2004 24 01 2004 alive other A56902 23 01 2004 27 01 2004 alive 40 community 70410 29 01 2004 30 other dl ni b ul ul m it ed 4 M 4 Mh icu_ admissions 3 Ready Sum 404434 Figure 3 2 1 Fichier source ICU_Admissions xls pour l importation dans NSIHwin 13 Exemple de surveillance ICU suite Le fichier ICU admissions dans le r
58. s doivent tre les valeurs de cat gorie exactes Les erreurs de validation peuvent tre r solues pour les deux champs via une proc dure automatique cette derni re est d crite dans la section 3 3 2 17 gs Qry_LinkErrors Select Query m TestDate Tablellame Fieldilame IDN RECORDNO 07 04 2004 linkthlicu_datai ADWSOTICU 440735 52 46 0P 2004 has no regular Date format 0704 2004 linkthlicu_datai Icu_DIS_S 264763 51 alive is not a valid category for this field 07 04 2004 linkthlicu_datai Icu_D 735 52 alive is ategory for this field OFA O4 linkthlicu_datai lcu_D y elc I ata lcu_D lcu_D lcu_DIS Ilcu_DIS S L ii Icu_DIS_ST4 456902 59 aliv re is not a valid c sega r for this 0704 2004 linkthlicu_datai IDN 264763 264763 must be present in thlPatient IDN 0704 2004 linkthlicu_datai IDN 440735 240735 must be present in thlPatient IDN 07 04 2004 linkthlicu_datai IDN 437568 837568 must be present in thlPatient IDN 0704 2004 linkthlicu_datai IDN 486398 286398 must be present in thlPatient IDN NZ 2004 linkthlicu datai IDN A1SFE6 S A1 SAAR must he nresent in thlPatient IDA Record 14 4 2 bibilr of 30 Figure 3 8 a 4 Liste Linkerrors avec les erreurs de validation s lectionn es pour le champ cat gorie Icu dis sta 888 Qry_LinkErrors Select Query TestDate Tabletame Fieldllame Ii RECORDNO Description 07 04 2004 linktblicu_data1 IDN 476410 60 276410 must be present in thlPatient I
59. s le tableau interm diaire de la d finition d importation ICU tblICU Lideno pour chaque p riode le code h pital le code unit la date de d but et de fin doivent tre compl t s dans des lignes diff rentes et manuellement Plusieurs p riodes par exemple les 3 mois d une p riode de participation sont donc autoris es La proc dure automatique compl te ensuite automatiquement les d nominateurs manquants pour chaque p riode en agr geant les donn es d admission Surveillance NSIH SEP Importation des donn es du d nominateur via la d finition SEP Denominators thbldeno_hos Proc dure de mise jour Description transforms hospital admission Sur la base des donn es d admission l h pital import es et d une data to hospital denominator p riode sp cifique cette proc dure calcule automatiquement les for SEP surveillance donn es du d nominateur pour l ensemble de l h pital Les donn es d admission l h pital doivent tre import es dans le tableau interm diaire via la d finition d importation pour Hospital Admissions tblpatient L importation finale avec la validation correspondante n est donc pas n cessaire Seuls les champs code h pital date d admission et date de sortie pour chaque patient doivent tre fournis La p riode pour laquelle le d nominateur doit tre calcul doit ensuite tre indiqu e dans le tableau interm diaire de la d finition d importation De
60. spital patient operation date INHSN code 19705 2010 Figure 3 3 b 8 proc dures de mise jour pour le tableau tblswilnter1 Exemple de surveillance SSI suite o Il subsiste encore les erreurs de validation pour les valeurs manquantes dans les champs interno opnnisi opdurat_n opnnsirisk et swil_id0 Le champ interno peut tre compl t via la proc dure sets interno to 1 where empty Le champ avec la cat gorie d op ration NHSN peut tre d termin via la proc dure option 1 fills NHSN1 2 3 based on ICD9 CM1 2 3 where empty Le champ avec l indice de risque NHSN peut tre calcul via la proc dure fills risk index where empty gt La dur e de l op ration opdurat_n peut tre calcul e via la proc dure fills in duration based on begins ends where empty Le champ swil_id0 peut tre d termin via la proc dure fills swil_id0 where empty o En s lectionnant les proc dures ci dessus et en cliquant sur Run Selected ces proc dures sont ex cut es et le tableau interm diaire peut ensuite tre contr l Figure 3 3 b 9 On peut ici observer que les colonnes interno opnnis1 opdurat_n opnnsirisk et swil_id0 ont t compl t es D linktblswiinter1 Table nopan Swi oo Jon run error opcoot o ECOLES OPRAEST 2 12A1 2000 1 15 0201 2000 530 0401 2008 M0Ot 2008 AO 2000 2008 1 21 2000 14 0201 2008 0201 0008
61. ssaire il est galement possible de d doubler les observations dans le fichier source voir plus loin dans la section 3 3 donn es interm diaires La correction des noms de champs non correspondants n cessite une adaptation du nom de la colonne dans le fichier source original ainsi qu un nouveau chargement du fichier Bien qu il ne soit pas n cessaire de corriger les champs non valid s il va de soi que seuls les champs corrects pourront tre import s dans le tableau interm diaire et de destination Apr s le chargement l emplacement et le nom du fichier source apparaissent dans le champ Source File Le nom du tableau NSIHwin d origine contenant les donn es sources dans un format MS Access appara t dans le champ Source Table Il importer de noter que le nom du fichier source ne doit pas tre n cessairement identique au nom du tableau d origine Le tableau d origine peut tre ouvert et ventuellement adapt en cliquant sur le bouton Open Exemple surveillance ICU le fichier MS Excel fichier de la figure 3 2 1 comprend les donn es de 10 s jours de patients aux soins intensifs en janvier 2004 avec les colonnes num ro d admission IDN unit ICU Unit date d admission dans l unit admdate date de sortie icu_ dis dt tat du patient au moment de sa sortie dissta score SAPS saps tot et origine origin n Le fichier est sauvegard dans le r pe
62. t cliquer sur run selected permet ensuite de corriger les cat gories compl t es dans le tableau contenant les donn es 21 Interm diaires User specific field categories 0O EEN Run Last Run g selected Figure 3 3 b 1 Correction des valeurs de cat gorie bouton user specific field categories option convert user categories et bouton Run selected NSIHwin Field Category Conversion Field name Default Category category description DE A EE DE D A 7 EE D D CE EDS 050 finpramiten ot cardiac resynchronizaton pacs jom O pos fronton of cardiac resyochronizaton de jom pos prenar eoceno cardiac res jom O pose immiaton or replacement or cardiac resed D pono UE jom 2 UE jom O porz REVISON OF FIP REPLACEMENT femora pom 2 REVITON OF HIP REPIACENENT acetabu jom poo REVITON OF KNEE REPIACENENT ar O jom pom REVISON OF KNEE REPIACEWENT tiei pom fe RENOM OF KNEE REPIACEWENT emor jom pos REVON OF KNEE REPLACEMENT pate jom pos REVISON OF KNEE REPIACEWENT NS pm OO poss feswacina hip totel acetabulum and emor Record 14 4 1 gt PI gt of 802 Filtered Figure 3 3 b 2 cran Field Category Conversion pour la d finition d importation de SSI Interventions Pour une d finition d importation sp cifique l onglet Correct intermediate data fournit une liste des proc dures de mise jour figure 3 3 b 3 La colonne Description d cri
63. t l objet de chaque proc dure La colonne Last Run la date et l heure auxquelles la derni re proc dure a t effectu e Le champ option dans la derni re colonne permet de s lectionner une ou plusieurs proc dure s pour ensuite les ex cuter en cliquant sur le bouton Run selected En cliquant sur Run selected les proc dures de mise jour coch es seront ex cut es une par une dans l ordre d apparition dans la liste la suite de quoi la date et l heure d ex cution de chaque proc dure seront indiqu es dans la colonne Last run et le tableau interm diaire dont les donn es ont t adapt es est ouvert des fins de contr le NSlHwin Import Definitions 1 IMPORT DEFINITION Definition Protocol Destination table Table Field tbiswinter v Fields Categories Open Source data Intermediate data Correct intermediate data Destination data 5 CORRECT INTERMEDIATE TABLE Correction Ho Query Description Run sel Olorylinktbis v appends missing h_code to table tblhospital loryinktbis w appends missing idn codes to tblpatient 2ary_inktbis s appends missing opsurg1 to table tkpswisurg 3jarylinktblis v appends missing opsurg3 to table tkpswisurg 3laryiinktbis wv appends missing opsurg2 to table tkpswisurg D LC LE OL EL EE EL v paten E NS eae e OO B ENA limita latinn A silla FRIC NA MAI hanna mm MODNA ORAA NITI valu mmiki
64. tal admissions thlpatient et depuis l importation de donn es d admission ICU minimales dans la d finition ICU level 2 1 ICU admissions tblICU_ data Une proc dure automatique dans la d finition SEP Denominators toldeno_hos peut les convertir pour les p riodes indiqu es en d nominateurs requis Cette proc dure automatique est d crite dans le point 3 3 3 surveillance SEP importation des donn es de d nominateur gt Exemple de surveillance ICU level 1 Pour une participation ax e sur l unit la surveillance des Infections contract es aux soins intensifs il est possible de pr parer les donn es dans MS Excel de la fa on suivante o Une premi re liste MS Excel contient des informations relatives aux infections et est import e via la d finition ICU Level 1 2 Infections tbllCU_ bacs Comme mentionn plus haut les hospitalisations des patients avec une Infection sont compl t es automatiquement dans le tableau concern il n est donc pas n cessaire de les importer s par ment o Une deuxi me liste Excel contient des donn es sur les microorganismes et les antibiogrammes et est import e via la d finition ICU Microorganisms and AMR markers tblicumo_ab Cette liste a t r dig e sous la forme de combinaisons culture antibiotiques qui sont r parties sur plusieurs lignes par microorganisme trouv o Si n cessaire il est possible de cr er automatiquement le d nomina
65. teur agr g es partir des fichiers comprenant des donn es d admission individuelles constitue parfois un processus extr mement lourd Le module d importation dispose cet effet d une s rie de proc dures d agr gation qui permettent de convertir des donn es individuelles relatives l admission ou la sortie de l h pital en d nominateurs obligatoires pour les surveillances ax es sur l unit Exemple de surveillance SEP Pour l enregistrement selon la surveillance Septic mies hospital wide il est possible de pr parer des donn es dans MS Excel de la fa on suivante o Une premi re liste MS Excel contient des informations relatives la septic mie et est import e via la d finition Septicemia tblSep gt Comme mentionn plus haut les hospitalisations des patients avec des Septic mies sont compl t es automatiquement dans le tableau concern il n est donc pas n cessaire de les importer s par ment o Une deuxi me liste Excel contient des donn es sur les microorganismes et les antibiogrammes et est import e via la d finition SEP Microorganisms and AMR markers thblsepmo_ab Cette liste a t r dig e sous la forme de combinaisons culture antibiotiques qui sont r parties sur plusieurs lignes par microorganisme trouv o Si n cessaire il est possible de cr er automatiquement le d nominateur requis depuis l importation des donn es d hospitalisation minimales dans la d finition ALL Hospi
66. teur requis depuis l importation des donn es d admission ICU minimales dans la d finition ICU level 2 1 ICU admissions tblICU data Une proc dure automatique dans la d finition ICU level 1 Denominators tolICU Lideno peut les convertir pour les p riodes indiqu es en d nominateurs requis Cette proc dure automatique est d crite dans le point 3 3 3 surveillance ICU importation des donn es de d nominateur gt 3 1 2 Ouverture d une d finition d importation Apr s avoir s lectionn une d finition d importation s lection d une ligne et avoir cliqu sur Open la fen tre NSIHwin import Definition figure 3 1 4 appara t Celle ci contient toutes les informations importantes pour cette d finition ainsi qu une s rie de boutons permettant d effectuer la proc dure d importation Hormis les boutons disponibles il est important de laisser les champs inchang s On risque en effet de modifier la d finition d importation ce qui peut en rendre l utilisation impossible E NSlHwin Import Definitions 1 IMPORT DEFINITION Definition Protocol Destination table Table Field tblicu_data Fields Categories Source data Intermediate data Correct intermediate data Destination data 2 SOURCE DATA Source File Source Table es Upload Errors Open Figure 3 1 4 D finition d importation pour le tableau de destination tblicu_ data La fen tre NSIHwin import definit
67. uite compl ter manuellement via les crans de saisie le reste des donn es relatives la surveillance apr s la sortie ou d ventuelles infections chaque ligne d signe une proc dure chirurgicale avec des variables sp cifiques au niveau de l intervention comme la date d intervention le code ICD 9 CM ou le score ASA L option de surveillance 1 a t choisie voir le protocole de la surveillance SSI du fait que les donn es d intervention sont collect es via le code ICD 9 CM plut t que la cat gorie d op ration NHSN une seule intervention sur le m me patient et au m me moment peut s tendre sur plusieurs lignes via diff rentes proc dures celles ci sont d sign es par leur code ICD 9 CM la liste sera utilis e pour l importation de tblswiinter il s agit du tableau NSIHwin comprenant les donn es d intervention La liste a avant tout t labor e pour contenir les champs obligatoires de ce tableau voir le rapport table fields des d finitions d importation l exception des champs suivants qui doivent tre d termin s automatiquement pendant la proc dure d importation voir plus loin swil_id0 doit tre d termin sur la base des champs h code idn interdt interno interno num ro de la proc dure en cas de proc dures multiples sur le m me patient et le m me jour g n ralement 1 opnnisi cat gorie d op ration NHSN qui doit tre d t

NSIHwin Manuel du Module d`importation

Contents

Download Pdf Manuals

Related Search

Related Contents